植物化学与西部植物资源持续利用国家重点实验室的前身为1957 年创建的中国科学院植物研究所昆明工作站植物资源化学研究组。1958 年昆明工作站扩建为植物研究所昆明分所,植物资源化学研究组改名为野生植物资源利用研究室,1963 年改称为植物化学研究室。1987 年8 月研究室成为中国科学院植物化学开放研究实验室,2001 年10 月经国家科技部批准开始建设为国家重点实验室,2003 年8 月通过验收,2006 年、2011、2017 年通过评估,获得良好的成绩。

       本实验室定位于“植物化学与植物资源持续利用”的基础研究和应用基础研究,面向学科前沿和国家重大需求,以我国西部地区丰富的植物资源为研究对象,以天然产物为核心,有机化学为基础,与生命科学等多学科合作交叉,开展植物化学与植物资源、天然产物活性与功能、天然产物化学合成与生物合成、创新天然药物等研究,为我国植物化学、天然药物化学学科发展和植物资源持续利用做出贡献,逐步建设成为引领国际植物化学领域的研究中心之一。