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基于牛角瓜基因组解析其种子纤维发育和镉胁迫响应的机理 学位论文
: 中国科学院大学, 2022
作者:  杨景雅
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牛角瓜，基因组，比较基因组，纤维发育，镉胁迫，分子机制  Calotropis, Genomics, Comparative genome, Fiber development, Cadmium stress, Molecular mechanism.  
构建多组学数据分析流程用于挖掘黄草乌生物碱合成相关基因 学位论文
: 中国科学院大学, 2022
作者:  任焕幸
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二萜生物碱  Diterpenoid alkaloids  比较基因组学  Comparative genomics  权重基因共表达网络  Weighted gene co-expression network  最小生成树  Minimum spanning tree  代谢网络  Metabolic network  
禾本科植物MADS-box基因家族鉴定及系统进化分析 学位论文
: 中国科学院大学, 2022
作者:  李思巧
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禾本科  Poaceae  MADS-box基因家族  MADS-box gene family  系统进化  Phylogeny  
自养种子植物IR丢失类群叶绿体基因组进化研究 学位论文
: 中国科学院大学, 2022
作者:  王子洵
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比较基因组学，IR丢失，叶绿体基因组，替换速率，结构变异  comparative genomics, plastid genome, inverted repeat (IR), structural variation, substitution rate  
Plastome characteristics and species identification of Chinese medicinal wintergreens (Gaultheria, Ericaceae) 期刊论文
PLANT DIVERSITY, 2022, 卷号: 44, 期号: 6, 页码: 519-529
作者:  Xu, Yan-Ling;  Shen, Hao-Hua;  Du, Xin-Yu;  Lu, Lu
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DNA barcodes  Gene duplication  Plastome  Repeat sequences  Structural variation  CHLOROPLAST GENOME  PHYLOGENETIC ANALYSIS  INVERTED REPEAT  EVOLUTION  SEQUENCE  DNA  SOFTWARE  INSIGHTS  REARRANGEMENTS  ORGANIZATION  
Gene fusion as an important mechanism to generate new genes in the genus Oryza 期刊论文
GENOME BIOLOGY, 2022, 卷号: 23, 期号: 1, 页码: 130
作者:  Zhou, Yanli;  Zhang, Chengjun;  Zhang, Li;  Ye, Qiannan;  Liu, Ningyawen;  Wang, Muhua;  Long, Guangqiang;  Fan, Wei;  Lon, Manyuan;  Wing, Rod A.
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Fusion gene  Oryza  Evolutionary patterns  Phenotype  TRANSPOSABLE ELEMENTS  RAPID EVOLUTION  CHIMERIC GENES  RICE GENOME  DUPLICATION  EXPRESSION  RETROPOSITION  ORIGINATION  COMPLEXITY  GLABERRIMA  
Genome-Wide Identification and Functional Analysis of the Calcineurin B-like Protein and Calcineurin B-like Protein-Interacting Protein Kinase Gene Families in Chinese Cabbage (Brassica rapa ssp. pekinensis) 期刊论文
GENES, 2022, 卷号: 13, 期号: 5, 页码: 795
作者:  Wang, Qianwen;  Zhao, Kai;  Gong, Yuqiang;  Yang, Yunqiang;  Yue, Yanling
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abiotic stresses  BraCBL-BraCIPK  Chinese cabbage  expression profiles  functional differentiation  preferential interactions  CALCIUM SENSOR  PHYLOGENETIC ANALYSIS  ION HOMEOSTASIS  PLANT-GROWTH  ORYZA-SATIVA  ARABIDOPSIS  EVOLUTION  RESPONSES  CHANNEL  DOMAIN  
Phylotranscriptomic analyses reveal multiple whole-genome duplication events, the history of diversification and adaptations in the Araceae 期刊论文
ANNALS OF BOTANY, 2022
作者:  Zhao, Lei;  Yang, Ying-Ying;  Qu, Xiao-Jian;  Ma, Hong;  Hu, Yi;  Li, Hong-Tao;  Yi, Ting-Shuang;  Li, De-Zhu
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Araceae  diversification  phylogenomics  WGDs  adaptation  TRAIT-DEPENDENT SPECIATION  GENE DUPLICATION  ANGIOSPERM DIVERSIFICATION  PHYLOGENOMIC ANALYSES  NUCLEAR GENES  POLYPLOIDY  EVOLUTIONARY  FAMILY  RATES  TOOL  
Comparative Chloroplast Genome Analysis of Wax Gourd (Benincasa hispida) with Three Benincaseae Species, Revealing Evolutionary Dynamic Patterns and Phylogenetic Implications 期刊论文
GENES, 2022, 卷号: 13, 期号: 3, 页码: 461
作者:  Song, Weicai;  Chen, Zimeng;  He, Li;  Feng, Qi;  Zhang, Hongrui;  Du, Guilin;  Shi, Chao;  Wang, Shuo
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Benincasa hispida  chloroplast genome  comparative analysis  divergence region  phylogenetic  CUCURBITACEAE  SEQUENCES  PLANTS  ANNOTATION  EXTRACT  FAMILY  FRUITS  GENES  TOOLS  
Phylotranscriptomics of Theaceae: generic-level relationships, reticulation and whole-genome duplication 期刊论文
ANNALS OF BOTANY, 2022, 卷号: 129, 期号: 4, 页码: 457-471
作者:  Zhang, Qiong;  Zhao, Lei;  Folk, Ryan A.;  Zhao, Jian-Li;  Zamora, Nelson A.;  Yang, Shi-Xiong;  Soltis, Douglas E.;  Soltis, Pamela S.;  Gao, Lian-Ming;  Peng, Hua;  Yu, Xiang-Qin
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