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Population structure of wild soybean (Glycine soja) based on SLAF-seq have implications for its conservation 期刊论文
PEERJ, 2023, 卷号: 11, 页码: e16415
作者:  Meng,Jing;  Yang,Guoqian;  Li,Xuejiao;  Zhao,Yan;  He,Shuilian
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Glycine soja  SLAF-seq  Genetic diversity  Population structure  SPATIAL GENETIC-STRUCTURE  TOOL SET  DIVERSITY  SIEB.  CHINESE  DNA  ZUCC.  DIFFERENTIATION  PHYLOGEOGRAPHY  HISTORY  
A comparative full-length transcriptomic resource provides insight into the perennial monocarpic mass flowering 期刊论文
PLANT JOURNAL, 2023, 卷号: 116, 期号: 6, 页码: 1842-1855
作者:  Zhao,Jiu-Xia;  Wang,Shu;  Liu,Jiazhi;  Jiang,Xiao-Dong;  Wen,Jing;  Suo,Zhi-Quan;  Liu,Jie;  Zhong,Mi-Cai;  Wang,Qin;  Gu,Zhirong;  Liu,Changning;  Deng,Yunfei;  Hu,Jin-Yong;  Li,De-Zhu
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perennial monocarpic mass flowering  Strobilanthes  ISO-seq  RNA-seq  BlueOmics  PSEUDO-RESPONSE REGULATORS  STROBILANTHES ACANTHACEAE  EXPRESSION ANALYSIS  GENE  TIME  PROTEIN  LONG  FKF1  PRR5  CLASSIFICATION  
Phylotranscriptomic analyses reveal deep gene tree discordance in Camellia (Theaceae) 期刊论文
MOLECULAR PHYLOGENETICS AND EVOLUTION, 2023, 卷号: 188, 页码: 107912
作者:  Zhang,Qiong;  Folk,Ryan A.;  Mo,Zhi-Qiong;  Ye,Hang;  Zhang,Zhao-Yuan;  Peng,Hua;  Zhao,Jian-Li;  Yang,Shi-Xiong;  Yu,Xiang-Qin
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Camellia  Gene tree discordance  Transcriptome  Rapid diversification  Selective pressure  RNA-SEQ DATA  PHYLOGENETIC ANALYSIS  NUCLEAR GENES  SEQUENCE  EVOLUTION  RESOLUTION  HISTORY  INFERENCE  ALGORITHM  SELECTION  
Testing complete plastomes and nuclear ribosomal DNA sequences for species identification in a taxonomically difficult bamboo genus Fargesia 期刊论文
PLANT DIVERSITY, 2023, 卷号: 45, 期号: 2, 页码: 147-155
作者:  Lv,Shi-Yu;  Ye,Xia-Ying;  Li,Zhong-Hu;  Ma,Peng-Fei;  Li,De-Zhu
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Fargesia  Genome-skimming  DNA barcoding  Plastome  Ribosomal DNA  WHOLE CHLOROPLAST GENOMES  RNA-SEQ DATA  ARUNDINARIEAE POACEAE  BAMBUSOIDEAE  TEMPERATE  PLATFORM  
Variation in gene expression along an elevation gradient of Rhododendron sanguineum var. haemaleum assessed in a comparative transcriptomic analysis 期刊论文
FRONTIERS IN PLANT SCIENCE, 2023, 卷号: 14, 页码: 1133065
作者:  Ye,Lin-Jiang;  Moller,Michael;  Luo,Ya-Huang;  Zou,Jia-Yun;  Zheng,Wei;  Liu,Jie;  Li,De-Zhu;  Gao,Lian-Ming
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Rhododendron  elevational gradients  evolutionary adaptation  RNA-seq  organ-specific profile  alpine ecosystem  YOUNG LEAVES  ADAPTATION  ANTHOCYANINS  BIOSYNTHESIS  GENERATION  DIVERSITY  ALIGNMENT  ALTITUDE  PHOTOSYNTHESIS  REPRODUCTION  
Effects of Low Nighttime Temperature on Fatty Acid Content in Developing Seeds from Brassica napus L. Based on RNA-Seq and Metabolome 期刊论文
PLANTS-BASEL, 2023, 卷号: 12, 期号: 2, 页码: 325
作者:  Mi,Chao;  Sun,Chao;  Yuan,Yuting;  Li,Fei;  Wang,Qian;  Zhu,Haiping;  Hua,Shuijin;  Lin,Liangbin
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Brassica napus L  seeds  nighttime temperature  fatty acid content  RNA-seq  metabolome  cis-acting element involved in low-temperature responsiveness  oleic acid  erucic acid  HB1  KCS  TRANSCRIPTION FACTOR  OIL  EXPRESSION  STORAGE  GENES  CANOLA  LEAFY-COTYLEDON1  BIOSYNTHESIS  ACCUMULATION  REVEALS  
瑞香狼毒（Stellera chamaejasme L.）物种分化机制的研究 学位论文
: 中国科学院大学, 2022
作者:  Santosh Kumar Rana Magar
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cryptic morphs, Pleistocene glaciation, population, RAD-seq, speciation, Stellera chamaejasme, ‘Third Pole’, transcriptome  
喜马拉雅-横断山区代表类群的进化历史 学位论文
: 中国科学院大学, 2022
作者:  Hum Kala Rana
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生物地理分界线  Biogeographical barriers  遗传-环境相关性  Genetic-environment association  古河流演变  Paleo-drainage evolution  青藏高原  Qinghai-Tibetan Plateau s.l.  RAD-seq  RAD-seq  天空岛，物种分布区模拟  Sky Island  Species distribution modeling  
极小种群野生植物显脉木兰的保护遗传学研究 学位论文
: 中国科学院大学, 2022
作者:  杨丰懋
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保护遗传学，简化基因组，种群历史动态，极小种群野生植物，显脉木兰  Conservation genetics, RAD-seq, Demographic history, Plant Species with Extremely Small Populations, Magnolia fistulosa  
保护生物学的技术方法在极度濒危植物紫花杜鹃中的应用 学位论文
: 中国科学院大学, 2022
作者:  敖艺山
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ddRAD-seq、遗传多样性、群体遗传学、保护策略  ddRAD-seq、Genetic Diversity、Population genetics、Conservation Strategy