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Phylogenomics resolves the rediscovered Himalayan endemic Brachymeniopsis gymnostoma (Bryophyta, Funariaceae), as a species of Entosthodon, prompting also the transfer of Clavitheca poeltii 期刊论文
TAXON, 2023, 卷号: 72, 期号: 6, 页码: 1216-1227
作者:  Zhang,Li;  Zuo,Qin;  Ma,Wen-Zhang;  Shevock,James R.;  Patel,Nikisha;  Johnson,Matthew;  Medina,Rafael;  Wilding,Nicholas;  Goffinet,Bernard
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mosses  nomenclature  phylogenomic reference  taxonomy  RAPID RADIATION  MOSS CALYPTRA  PHYSCOMITRELLA  REJECTS  CUTICLE  
Characterization of the complete chloroplast genome of Amsonia elliptica (Apocynaceae) 期刊论文
MITOCHONDRIAL DNA PART B-RESOURCES, 2023, 卷号: 8, 期号: 3, 页码: 461-465
作者:  Kim,Yongsung;  Nam,Bo-Mi;  Kim,Iseon;  Deng,Tao;  Kim,Changkyun
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Amsonia elliptica  Apocynaceae  chloroplast genome  endangered species  phylogenomic analyses  PLASTOME SEQUENCE  CHOICE  
Systematic arrangement within the family Clitocybaceae (Tricholomatineae, Agaricales): phylogenetic and phylogenomic evidence, morphological data and muscarine-producing innovation 期刊论文
FUNGAL DIVERSITY, 2023, 卷号: 123, 期号: 1, 页码: 1-47
作者:  He,Zheng-Mi;  Chen,Zuo-Hong;  Bau,Tolgor;  Wang,Geng-Shen;  Yang,Zhu L.
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Clitocybe  Clitocyboid  Collybia  Muscarine  Phylogenomic analysis  Single-copy gene  
Plastome evolution in the East Asian lobelias (Lobelioideae) using phylogenomic and comparative analyses 期刊论文
FRONTIERS IN PLANT SCIENCE, 2023, 卷号: 14, 页码: 1144406
作者:  Li,Chun-Jiao;  Xie,Xin-Tong;  Liu,Hong-Xin;  Wang,Ruo-Nan;  Li,De-Zhu
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East Asian lobelias  plastomes  phylogenomic framework  highly divergent regions  positive selection  adaptive evolution  INVERTED REPEAT  HIGH-ALTITUDE  CAMPANULACEAE  GENOMES  SELECTION  EXPANSION  SEQUENCE  TOOLS  GENE  DNA  
唇形科叶绿体系统发育基因组学研究 ——兼论假野芝麻属的系统学位置 学位论文
: 中国科学院大学, 2022
作者:  赵飞
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唇形科，野芝麻亚科，假野芝麻属，族间关系，系统发育基因组学  Lamiaceae, Lamioideae, Paralamium, tribe relationships, phylogenomic  
荨麻族的分子系统发育、叶绿体基因组演化及其大蝎子草属 的物种界定研究 学位论文
: 中国科学院大学, 2022
作者:  CATHERINE AKINYI OGOMA
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荨麻族，叶绿体结构进化，系统发育基因组学，基因组浅层测序，大蝎子草属， 物种界定，荨麻科  Urticeae, plastome structural evolution, phylogenomic, genome skimming, Girardinia, automated species delimitation, molecular taxonomy, Urticaceae.  
Phylogenomic and comparative analyses of Coffeeae alliance (Rubiaceae): deep insights into phylogenetic relationships and plastome evolution 期刊论文
BMC PLANT BIOLOGY, 2022, 卷号: 22, 期号: 1, 页码: 88
作者:  Amenu, Sara Getachew;  Wei, Neng;  Wu, Lei;  Oyebanji, Oyetola;  Hu, Guangwan;  Zhou, Yadong;  Wang, Qingfeng
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Coffeeae alliance  Phylogenomic  Plastome  Plastome structural variations (PSVs)  Rubiaceae  COMPLETE CHLOROPLAST GENOME  CODON USAGE BIAS  INVERTED REPEAT  SEQUENCE  ALIGNMENT  GENE  SUBFAMILIES  CONTRACTION  ANGIOSPERMS  EXPANSION  
Phylotranscriptomic analyses reveal multiple whole-genome duplication events, the history of diversification and adaptations in the Araceae 期刊论文
ANNALS OF BOTANY, 2022
作者:  Zhao, Lei;  Yang, Ying-Ying;  Qu, Xiao-Jian;  Ma, Hong;  Hu, Yi;  Li, Hong-Tao;  Yi, Ting-Shuang;  Li, De-Zhu
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Araceae  diversification  phylogenomics  WGDs  adaptation  TRAIT-DEPENDENT SPECIATION  GENE DUPLICATION  ANGIOSPERM DIVERSIFICATION  PHYLOGENOMIC ANALYSES  NUCLEAR GENES  POLYPLOIDY  EVOLUTIONARY  FAMILY  RATES  TOOL  
Organelle Phylogenomics and Extensive Conflicting Phylogenetic Signals in the Monocot Order Poales 期刊论文
FRONTIERS IN PLANT SCIENCE, 2022, 卷号: 12, 页码: 824672
作者:  Wu, Hong;  Yang, Jun-Bo;  Liu, Jing-Xia;  Li, De-Zhu;  Ma, Peng-Fei
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Poales  phylogenomic conflict  plastome  mitochondrial  nuclear  EVOLUTIONARY SIGNIFICANCE  PLASTID GENOMES  NUCLEAR GENES  SEQUENCE DATA  TREE  MITOCHONDRIAL  DIVERSIFICATION  FAMILIES  RBCL  CLASSIFICATION  
The complete chloroplast genome sequence of Metabriggsia ovalifolia W. T. Wang (Gesneriaceae), a national key protected plant endemic to Karst areas in China 期刊论文
MITOCHONDRIAL DNA PART B-RESOURCES, 2021, 卷号: 6, 期号: 3, 页码: 833-834
作者:  Tian,Xiaoling;  Wariss,Hafiz Muhammad
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Metabriggsia ovalifolia  endemic plant  chloroplast genome  phylogenomic analysis