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Phylogenomic insights into the reticulate evolution of Camellia sect. Paracamellia Sealy (Theaceae)
期刊论文
JOURNAL OF SYSTEMATICS AND EVOLUTION, 2023
作者:
Qin,Sheng-Yuan
;
Chen,Kai
;
Zhang,Wen-Ju
;
Xiang,Xiao-Guo
;
Zuo,Zheng-Yu
;
Guo,Cen
;
Zhao,Yao
;
Li,Lin-Feng
;
Wang,Yu-Guo
;
Song,Zhi-Ping
;
Yang,Ji
;
Yang,Xiao-Qiang
;
Zhang,Jian
;
Jin,Wei-Tao
;
Wen,Qiang
;
Zhao,Song-Zi
;
Chen,Jia-Kuan
;
Li,De-Zhu
;
Rong,Jun
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提交时间:2024/07/10
Camellia oleifera
hybridization
phylogenomics
plastome
polyploidization
transcriptome
EVERGREEN BROADLEAVED FORESTS
HISTORY
DYNAMICS
OLEIFERA
CHINA
PHYLOGEOGRAPHY
ALIGNMENT
TREE
Phylogenomic insights into the origin and evolutionary history of evergreen broadleaved forests in East Asia under Cenozoic climate change
期刊论文
MOLECULAR ECOLOGY, 2023, 卷号: 32, 期号: 11, 页码: 2850-2868
作者:
Qin,Sheng-Yuan
;
Zuo,Zheng-Yu
;
Guo,Cen
;
Du,Xin-Yu
;
Liu,Shui-Yin
;
Yu,Xiang-Qin
;
Xiang,Xiao-Guo
;
Rong,Jun
;
Liu,Bing
;
Liu,Zhi-Fang
;
Ma,Peng-Fei
;
Li,De-Zhu
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提交时间:2024/07/10
East Asian monsoon
evergreen broadleaved forests
genome resequencing
Lauraceae
Litsea complex
single-nucleotide variants
SOUTHERN CHINA EVIDENCE
NORTHERN-HEMISPHERE
MOLECULAR PHYLOGENY
SPECIES RICHNESS
LITSEA COMPLEX
R PACKAGE
LAURACEAE
EOCENE
TERTIARY
BIOGEOGRAPHY
Phylogenomics and the flowering plant tree of life
期刊论文
JOURNAL OF INTEGRATIVE PLANT BIOLOGY, 2022
作者:
Guo, Cen
;
Luo, Yang
;
Gao, Lian-Ming
;
Yi, Ting-Shuang
;
Li, Hong-Tao
;
Yang, Jun-Bo
;
Li, De-Zhu
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提交时间:2024/08/21
angiosperms
hybridization
incomplete lineage sorting
orthology inference
phylogenetic conflicts
reduced representation sequencing
whole-genome sequencing
whole-genome duplication
SYSTEMATIC-ERRORS
RNA-SEQ
SEQUENCE CAPTURE
SEED PLANTS
DATA SETS
GENOME
EVOLUTION
RADSEQ
TOOL
CLASSIFICATION
Phylogenomics of Fargesia and Yushania reveals a history of reticulate evolution
期刊论文
JOURNAL OF SYSTEMATICS AND EVOLUTION, 2021, 卷号: 59, 期号: 6, 页码: 1183-1197
作者:
Ye,Xia-Ying
;
Ma,Peng-Fei
;
Guo,Cen
;
Li,De-Zhu
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提交时间:2022/04/02
plastome
ddRAD
Fargesia
phylogenetic incongruence
reticulate evolution
Yushania
CONFLICTING GENE TREES
BAMBOOS POACEAE
ARUNDINARIEAE POACEAE
PHYLOGENETIC-RELATIONSHIPS
MORPHOLOGICAL EVOLUTION
BALANCING SELECTION
THAMNOCALAMUS GROUP
ALLIES GRAMINEAE
RADSEQ DATA
GBSSI GENE
Resolving robust phylogenetic relationships of core Brassicaceae using genome skimming data
期刊论文
JOURNAL OF SYSTEMATICS AND EVOLUTION, 2021, 卷号: 59, 期号: 3, 页码: 442-453
作者:
Liu,Liang-Min
;
Du,Xin-Yu
;
Guo,Cen
;
Li,De-Zhu
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提交时间:2022/04/02
core Brassicaceae
incongruence
nuclear ribosome DNA
plastid genome
MOLECULAR PHYLOGENY
CHLOROPLAST
TRIBE
BLOCKS
CHORISPOREAE
SYSTEMATICS
ANNOTATION
GENERATION
EVOLUTION
SELECTION
Parallel ddRAD and Genome Skimming Analyses Reveal a Radiative and Reticulate Evolutionary History of the Temperate Bamboos
期刊论文
SYSTEMATIC BIOLOGY, 2021, 卷号: 70, 期号: 4, 页码: 756-773
作者:
Guo,Cen
;
Ma,Peng-Fei
;
Yang,Guo-Qian
;
Ye,Xia-Ying
;
Guo,Ying
;
Liu,Jing-Xia
;
Liu,Yun-Long
;
Eaton,Deren A. R.
;
Guo,Zhen-Hua
;
Li,De-Zhu
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提交时间:2022/04/02
Arundinarieae
ddRAD
paleopolyploid
genome skimming
rapid diversification
incongruence
ARUNDINARIEAE POACEAE BAMBUSOIDEAE
SOUTH CHINA SEA
WOODY BAMBOOS
PHYLOGENOMIC ANALYSES
ADAPTIVE RADIATION
ECOLOGICAL OPPORTUNITY
PLANT DIVERSIFICATION
ASIAN MONSOON
RADSEQ DATA
GENE TREES
A new subtribal classification of Arundinarieae (Poaceae, Bambusoideae) with the description of a new genus
期刊论文
PLANT DIVERSITY, 2020
作者:
Zhang, Yu-Xiao
;
Guo, Cen
;
Li, De-Zhu
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提交时间:2021/01/05
Resolving robust phylogenetic relationships of core Brassicaceae using genome skimming data
期刊论文
JOURNAL OF SYSTEMATICS AND EVOLUTION, 2020
作者:
Liu, Liang-Min
;
Du, Xin-Yu
;
Guo, Cen
;
Li, De-Zhu
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提交时间:2021/01/05
ddRAD analyses reveal a credible phylogenetic relationship of the four main genera of Bambusa-Dendrocalamus-Gigantochloa complex (Poaceae: Bambusoideae)
期刊论文
MOLECULAR PHYLOGENETICS AND EVOLUTION, 2020
作者:
Liu, Jing-Xia
;
Zhou, Meng-Yuan
;
Yang, Guo-Qian
;
Zhang, Yu-Xiao
;
Ma, Peng-Fei
;
Guo, Cen
;
Vorontsova, Maria S.
;
Li, De-Zhu
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提交时间:2021/01/05
Genome Sequences Provide Insights into the Reticulate Origin and Unique Traits of Woody Bamboos
期刊论文
MOLECULAR PLANT, 2019, 卷号: 12, 期号: 10, 页码: 1353-1365
作者:
Guo, Zhen-Hua
;
Ma, Peng-Fei
;
Yang, Guo-Qian
;
Hu, Jin-Yong
;
Liu, Yun-Long
;
Xia, En-Hua
;
Zhong, Mi-Cai
;
Zhao, Lei
;
Sun, Gui-Ling
;
Xu, Yu-Xing
;
Zhao, You-Jie
;
Zhang, Yi-Chi
;
Zhang, Yu-Xiao
;
Zhang, Xue-Mei
;
Zhou, Meng-Yuan
;
Guo, Ying
;
Guo, Cen
;
Liu, Jing-Xia
;
Ye, Xia-Ying
;
Chen, Yun-Mei
;
Yang, Yang
;
Hang, Bin
;
Lin, Choun-Sea
;
Lu, Ying
;
Li, De-Zhu
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提交时间:2019/12/20
Bambusoideae
polyploidization
comparative genomics
subgenome evolution
flowering