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PGA: a software package for rapid, accurate, and flexible batch annotation of plastomes 期刊论文
PLANT METHODS, 2019, 卷号: 15, 页码: 12
作者:  Qu, Xiao-Jian;  Moore, Michael J.;  Li, De-Zhu;  Yi, Ting-Shuang
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PGA  Plastome  Batch annotation  Accuracy  BLAST  Software  Algorithms  
Origin of angiosperms and the puzzle of the Jurassic gap 期刊论文
NATURE PLANTS, 2019, 卷号: 5, 期号: 5, 页码: 461-470
作者:  Li, Hong-Tao;  Yi, Ting-Shuang;  Gao, Lian-Ming;  Ma, Peng-Fei;  Zhang, Ting;  Yang, Jun-Bo;  Gitzendanner, Matthew A.;  Fritsch, Peter W.;  Cai, Jie;  Luo, Yang;  Wang, Hong;  van der Bank, Michelle;  Zhang, Shu-Dong;  Wang, Qing-Feng;  Wang, Jian;  Zhang, Zhi-Rong;  Fu, Chao-Nan;  Yang, Jing;  Hollingsworth, Peter M.;  Chase, Mark W.;  Soltis, Douglas E.;  Soltis, Pamela S.;  Li, De-Zhu
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Evolutionary Comparisons of the Chloroplast Genome in Lauraceae and Insights into Loss Events in the Magnoliids 期刊论文
GENOME BIOLOGY AND EVOLUTION, 2017, 卷号: 9, 期号: 9, 页码: 2354-2364
作者:  Song, Yu;  Yu, Wen-Bin;  Tan, Yunhong;  Liu, Bing;  Yao, Xin;  Jin, Jianjun;  Padmanaba, Michael;  Yang, Jun-Bo;  Corlett, Richard T.
Adobe PDF(1863Kb)  |  收藏  |  浏览/下载：229/59  |  提交时间：2017/10/23
Lauraceae  Chloroplast  Genome  Phylogenetic Relationship  Loss Event  
Phylogeny and biogeography of the amphi-Pacific genus Aphananthe 期刊论文
PLOS ONE, 2017, 卷号: 12, 期号: 2, 页码: 171405
作者:  Yang, Mei-Qing;  Li, De-Zhu;  Wen, Jun;  Yi, Ting-Shuang
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Leaf epidermal character variation and evolution in Gaultherieae (Ericaceae) 期刊论文
BOTANICAL JOURNAL OF THE LINNEAN SOCIETY, 2015, 卷号: 178, 期号: 4, 页码: 686-710
作者:  Wang, Yin-Huan;  Lu, Lu;  Fritsch, Peter W.;  Wang, Hong;  Wang, Yue-Hua;  Li, De-Zhu
浏览  |  Adobe PDF(1937Kb)  |  收藏  |  浏览/下载：295/60  |  提交时间：2015/12/17
Fitch Parsimony  Hierarchical Bayesian Inference  Leaf Indumentum  Leaf Adaptation  Lineage Delimitation  
Complete Sequencing of Five Araliaceae Chloroplast Genomes and the Phylogenetic Implications 期刊论文
PLOS ONE, 2013, 卷号: 8, 期号: 10, 页码: e0078568
作者:  Li, Rong;  Ma, Peng-Fei;  Wen, Jun;  Yi, Ting-Shuang
浏览  |  Adobe PDF(2946Kb)  |  收藏  |  浏览/下载：322/86  |  提交时间：2014/01/13
Complete Nucleotide-sequence  Plastid Genomes  Maximum-likelihood  Scale Data  Evolution  Dna  Genes  Mitochondrial  Angiosperms  Nuclear  
Comparative Chloroplast Genomes of Camellia Species 期刊论文
PLOS ONE, 2013, 卷号: 8, 期号: 8
作者:  Yang, Jun-Bo;  Yang, Shi-Xiong;  Li, Hong-Tao;  Yang, Jing;  Li, De-Zhu
Adobe PDF(2156Kb)  |  收藏  |  浏览/下载：592/85  |  提交时间：2013/11/12
Bayesian Phylogenetic Inference  Multiple Sequence Alignment  Plastid Genomes  Inverted Repeat  Structural Organization  Nicotiana-tabacum  Vascular Plants  High-throughput  Dna  Theaceae  
Complete chloroplast genome of the genus Cymbidium: lights into the species identification, phylogenetic implications and population genetic analyses 期刊论文
BMC EVOLUTIONARY BIOLOGY, 2013, 卷号: 13, 期号: 1, 页码: 84
作者:  Yang, Jun-Bo;  Tang, Min;  Li, Hong-Tao;  Zhang, Zhi-Rong;  Li, De-Zhu
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Chloroplast Genome  Phylogenomics  Species Identification  Organelle-scale Barcodes  Phylogeny  Divergence Hotspot  
馆藏植物标本与iFlora 期刊论文
植物分类与资源学报, 2013, 期号: 6, 页码: 687-692
方涛; 曾春霞; 杨俊波; 李德铢*
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新一代植物志(Iflora)  植物标本  遗传信息  物种鉴定  
High-Throughput Sequencing of Six Bamboo Chloroplast Genomes: Phylogenetic Implications for Temperate Woody Bamboos (Poaceae: Bambusoideae) 期刊论文
PLOS ONE, 2011, 卷号: 6, 期号: 5, 页码: e20596
作者:  Zhang, Yun-Jie;  Ma, Peng-Fei;  Li, De-Zhu
Adobe PDF(1840Kb)  |  收藏  |  浏览/下载：430/134  |  提交时间：2012/06/12