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中国科学院昆明植物研究所知识管理系统
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Home at last: Molecular phylogenetic analyses support subsuming Metastachydium within Phlomoides (Lamiaceae)
期刊论文
TAXON, 2023
作者:
Zhao,Yue
;
Zhao,Fei
;
Salmaki,Yasaman
;
Paton,Alan
;
Cai,Jie
;
Drew,Bryan T.
;
Mahmoudi,Chonour
;
Efimov,Petr
;
Turginov,Orzimat T.
;
Liang,Cun-Zhu
;
Chen,Ya-Ping
;
Xiang,Chun-Lei
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提交时间:2024/07/10
Central Asia
Lamioideae
nrITS
Phlomideae
Phlomis
plastome phylogenomics
COMPLETE CHLOROPLAST GENOME
PLASTID DNA
LEPECHINIA LAMIACEAE
LAMIOIDEAE LAMIACEAE
CHARACTER EVOLUTION
NUCLEAR
CLASSIFICATION
POSITION
ORIGIN
GENERA
Deciphering complex reticulate evolution of Asian Buddleja (Scrophulariaceae): insights into the taxonomy and speciation of polyploid taxa in the Sino-Himalayan region
期刊论文
ANNALS OF BOTANY, 2023
作者:
Yang,Fengmao
;
Ge,Jia
;
Guo,Yongjie
;
Olmstead,Richard
;
Sun,Weibang
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提交时间:2024/05/09
Buddleja
phylogenomics
reticulate evolution
polyploidy
plastid genome
low-copy nuclear gene
HYBRIDIZATION
ALIGNMENT
DIVERSIFICATION
ALLOPOLYPLOIDY
PHYLOGENETICS
FRAMEWORK
NUCLEAR
ROBUST
FLOW
Characteristics of plastid genomes in the genus Ceratostigma inhabiting arid habitats in China and their phylogenomic implications
期刊论文
BMC PLANT BIOLOGY, 2023, 卷号: 23, 期号: 1, 页码: 303
作者:
Zhao,Yu-Juan
;
Liu,Jian
;
Yin,Gen-Shen
;
Gong,Xun
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提交时间:2024/05/09
Ceratostigma
Plastid genome
Comparative analysis
Interspecific relationship
Plumbaginaceae
COMPLETE CHLOROPLAST GENOME
MEKONG-SALWEEN DIVIDE
LIMONIUM-SINENSE
INVERTED REPEAT
SEQUENCE
EVOLUTION
DNA
PLUMBAGINACEAE
CONSEQUENCES
DIVERSITY
Plastome phylogenomics and morphological traits analyses provide new insights into the phylogenetic position, species delimitation and speciation of Triplostegia (Caprifoliaceae)
期刊论文
BMC PLANT BIOLOGY, 2023, 卷号: 23, 期号: 1, 页码: 645
作者:
Fu,Qing-Li
;
Mo,Zhi-Qiong
;
Xiang,Xiao-Guo
;
Milne,Richard I.
;
Jacquemyn,Hans
;
Burgess,Kevin S.
;
Sun,Ya-Nan
;
Yan,Hua
;
Qiu,Li
;
Yang,Bo-Yun
;
Tan,Shao-Lin
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提交时间:2024/05/09
Plastid genome
Phylogenomics
Speciation
Species delimitation
Triplostegia
FOREST DYNAMICS PLOT
HENGDUAN MOUNTAINS
ELEVATIONAL GRADIENT
SYSTEMATIC POSITION
RIVERINE BARRIER
DNA BARCODES
PLANT
DIPSACALES
SEQUENCE
DIVERSITY
自养种子植物IR丢失类群叶绿体基因组进化研究
学位论文
: 中国科学院大学, 2022
作者:
王子洵
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提交时间:2024/05/14
比较基因组学,IR丢失,叶绿体基因组,替换速率,结构变异
comparative genomics, plastid genome, inverted repeat (IR), structural variation, substitution rate
Characterization of the complete plastid genome of Scutellaria microviolacea (Lamiaceae), a species endemic to Yunnan Province of China
期刊论文
MITOCHONDRIAL DNA PART B-RESOURCES, 2022, 卷号: 7, 期号: 5, 页码: 758-760
作者:
Wang, Yong-Chao
;
Zhang, Zhi-Rong
;
Yan, Li-Jun
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提交时间:2024/04/30
Scutellaria microviolacea
endemic species
Lamiaceae
plastid genome
phylogeny
Comparative analyses of chloroplast genomes from Six Rhodiola species: variable DNA markers identification and phylogenetic relationships within the genus
期刊论文
BMC GENOMICS, 2022, 卷号: 23, 期号: 1, 页码: 577
作者:
Zhao, Kaihui
;
Li, Lianqiang
;
Quan, Hong
;
Yang, Junbo
;
Zhang, Zhirong
;
Liao, Zhihua
;
Lan, Xiaozhong
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提交时间:2024/04/30
Rhodiola
Chloroplast genome
Divergent hotspots
Phylogenetic analysis
GROUP CLASSIFICATION
FLOWERING PLANTS
PLASTID GENOMES
TRNH-PSBA
SEQUENCE
EVOLUTION
FAMILIES
REPEATS
UPDATE
ORDERS
Do taxon-specific DNA barcodes improve species discrimination relative to universal barcodes in Lauraceae?
期刊论文
BOTANICAL JOURNAL OF THE LINNEAN SOCIETY, 2022, 卷号: 199, 期号: 4, 页码: 741-753
作者:
Liu, Zhi-Fang
;
Ma, Hui
;
Zhang, Xiao-Yan
;
Ci, Xiu-Qin
;
Li, Lang
;
Hu, Jian-Lin
;
Zhang, Can-Yu
;
Xiao, Jian-Hua
;
Li, His-Wen
;
Conran, John G.
;
Twyford, Alex D.
;
Hollingsworth, Peter M.
;
Li, Jie
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提交时间:2024/04/30
DNA barcoding
ITS
phylogenetics
plastid DNA
specific barcode design
CHLOROPLAST GENOME
LAND PLANTS
GENE
WOOD
PHYLOGENY
FAGACEAE
FAILURE
Does IR-loss promote plastome structural variation and sequence evolution?
期刊论文
FRONTIERS IN PLANT SCIENCE, 2022, 卷号: 13, 页码: 888049
作者:
Wang, Zi-Xun
;
Wang, Ding-Jie
;
Yi, Ting-Shuang
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提交时间:2024/08/21
plastid genome evolution
structural variation
inverted repeat region loss
substitution rate
comparative genomics
CHLOROPLAST GENOME SEQUENCE
INVERTED REPEAT
NUCLEOTIDE SUBSTITUTION
PHYLOGENETIC ANALYSIS
MOLECULAR EVOLUTION
NONCODING RNAS
RATES
REARRANGEMENTS
ORGANIZATION
CUPRESSOPHYTES
The complete chloroplast genome of Cephalotaxus lanceolata (Taxaceae), a plant species with extremely small populations
期刊论文
MITOCHONDRIAL DNA PART B-RESOURCES, 2021, 卷号: 6, 期号: 3, 页码: 1116-1117
作者:
Ge,Jia
;
Xiong,Yun
;
Luo,Guifen
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提交时间:2022/04/02
Cephalotaxus lanceolata
chloroplast genome
plastid genome
plant species with extremely small populations