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中国科学院昆明植物研究所知识管理系统
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High-quality Cymbidium mannii genome and multifaceted regulation of crassulacean acid metabolism in epiphytes
期刊论文
PLANT COMMUNICATIONS, 2023, 卷号: 4, 期号: 5, 页码: 100564
作者:
Fan,Weishu
;
He,Zheng-Shan
;
Zhe,Mengqing
;
Feng,Jing-Qiu
;
Zhang,Le
;
Huang,Yiwei
;
Liu,Fang
;
Huang,Jia-Lin
;
Ya,Ji-Dong
;
Zhang,Shi-Bao
;
Yang,Jun-Bo
;
Zhu,Andan
;
Li,De-Zhu
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提交时间:2024/07/17
epiphytes
CAM photosynthesis
multi-omics
phase shifts
rhythmic metabolites
MASS-SPECTROMETRY
PHYLOGENETIC ANALYSIS
WIDE PREDICTION
EVOLUTION
CAM
SEQUENCE
ANNOTATION
ALIGNMENT
PATHWAYS
ORCHIDS
Comparative chloroplast genome analyses of diverse Phoebe (Lauraceae) species endemic to China provide insight into their phylogeographical origin
期刊论文
PEERJ, 2023, 卷号: 11, 页码: e14573
作者:
Shi,Wenbo
;
Song,Weicai
;
Chen,Zimeng
;
Cai,Haohong
;
Gong,Qin
;
Liu,Jin
;
Shi,Chao
;
Wang,Shuo
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提交时间:2024/07/17
Phoebe
Chloroplast genome
Comparative analysis
Phylogeny
Phylogeographical origin
Conservation
POLYMORPHISM ANALYSIS
SEQUENCE
DNA
ANNOTATION
REGION
TOOLS
Balanophora genomes display massively convergent evolution with other extreme holoparasites and provide novel insights into parasite-host interactions
期刊论文
NATURE PLANTS, 2023, 卷号: 9, 期号: 10, 页码: 1627-+
作者:
Chen,Xiaoli
;
Fang,Dongming
;
Xu,Yuxing
;
Duan,Kunyu
;
Yoshida,Satoko
;
Yang,Shuai
;
Sahu,Sunil Kumar
;
Fu,Hui
;
Guang,Xuanmin
;
Liu,Min
;
Wu,Chenyu
;
Liu,Yang
;
Mu,Weixue
;
Chen,Yewen
;
Fan,Yannan
;
Wang,Fang
;
Peng,Shufeng
;
Shi,Dishen
;
Wang,Yayu
;
Yu,Runxian
;
Zhang,Wen
;
Bai,Yuqing
;
Liu,Zhong-Jian
;
Yan,Qiaoshun
;
Liu,Xin
;
Xu,Xun
;
Yang,Huanming
;
Wu,Jianqiang
;
Graham,Sean W.
;
Liu,Huan
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提交时间:2024/07/22
RELAXED SELECTION
SALICYLIC-ACID
MESSENGER-RNA
LIFE-STYLE
PLANT
GENE
ANNOTATION
ALIGNMENT
TRANSPORTERS
RESISTANCE
Haplotype-resolved genomes of wild octoploid progenitors illuminate genomic diversifications from wild relatives to cultivated strawberry
期刊论文
NATURE PLANTS, 2023, 卷号: 9, 期号: 8, 页码: 1252-+
作者:
Jin,Xin
;
Du,Haiyuan
;
Zhu,Chumeng
;
Wan,Hong
;
Liu,Fang
;
Ruan,Jiwei
;
Mower,Jeffrey P.
;
Zhu,Andan
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提交时间:2024/07/22
FRAGARIA
ACCURATE
RECONSTRUCTION
EVOLUTIONARY
ALIGNMENT
ORIGIN
POPULATIONS
ASSEMBLIES
ANNOTATION
GENERATION
The genome of the glasshouse plant noble rhubarb (Rheum nobile) provides a window into alpine adaptation
期刊论文
COMMUNICATIONS BIOLOGY, 2023, 卷号: 6, 期号: 1, 页码: 706
作者:
Feng,Tao
;
Pucker,Boas
;
Kuang,Tianhui
;
Song,Bo
;
Yang,Ya
;
Lin,Nan
;
Zhang,Huajie
;
Moore,Michael J.
;
Brockington,Samuel F.
;
Wang,Qingfeng
;
Deng,Tao
;
Wang,Hengchang
;
Sun,Hang
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提交时间:2024/05/09
TRANSPOSABLE ELEMENTS
MOLECULAR EVOLUTION
TRANSLUCENT BRACTS
DIVERGENCE TIMES
ANNOTATION
TOOL
ALIGNMENT
POLYGONACEAE
PREDICTION
RETROTRA
A chromosome-level reference genome of an aromatic medicinal plant Adenosma buchneroides
期刊论文
SCIENTIFIC DATA, 2023, 卷号: 10, 期号: 1, 页码: 660
作者:
Huang,Hui
;
Wang,Chen
;
Pei,Shengji
;
Wang,Yuhua
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提交时间:2024/05/09
PHYLOGENETIC ANALYSIS
HI-C
TOOL
ANNOTATION
IDENTIFICATION
ALIGNMENT
TRANSCRIPTOME
PREDICTION
GENES
Haplotype-resolved chromosomal-level genome assembly of Buzhaye (Microcos paniculata)
期刊论文
SCIENTIFIC DATA, 2023, 卷号: 10, 期号: 1, 页码: 901
作者:
Liu,Detuan
;
Tian,Xiaoling
;
Shao,Shicheng
;
Ma,Yongpeng
;
Zhang,Rengang
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ANNOTATION
PROVIDES
SYSTEM
Arabidopsis AGAMOUS-LIKE16 and SUPPRESSOR OF CONSTANS1 regulate the genome-wide expression and flowering time
期刊论文
PLANT PHYSIOLOGY, 2023, 卷号: 192, 期号: 1, 页码: 154-169
作者:
Dong,Xue
;
Zhang,Li-Ping
;
Tang,Yin-Hua
;
Yu,Dongmei
;
Cheng,Fang
;
Dong,Yin-Xin
;
Jiang,Xiao-Dong
;
Qian,Fu-Ming
;
Guo,Zhen-Hua
;
Hu,Jin-Yong
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提交时间:2024/05/09
FLORAL TRANSITION
SOC1
FLC
MICRORNA
PATHWAYS
PROTEIN
IDENTIFICATION
CONTRIBUTES
ANNOTATION
DETERMINES
Comprehensive transcriptomic profiling reveals complex molecular mechanisms in the regulation of style-length dimorphism in Guettarda speciosa (Rubiaceae), a species with anomalous distyly
期刊论文
FRONTIERS IN PLANT SCIENCE, 2023, 卷号: 14, 页码: 1116078
作者:
Luo,Zhonglai
;
Zhao,Zhongtao
;
Xu,Yuanqing
;
Shi,Miaomiao
;
Tu,Tieyao
;
Pei,Nancai
;
Zhang,Dianxiang
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提交时间:2024/05/09
anomalous distyly
brassinosteroid signaling
Guettarda speciosa
heterostyly
molecular regulation
genetic convergence
PRIMULA-VULGARIS
GENE-EXPRESSION
ANNOTATION
PATHWAY
IDENTIFICATION
AUXIN
EVOLUTION
PROTEIN
GROWTH
BKI1
Progress, challenge and prospect of plant plastome annotation
期刊论文
FRONTIERS IN PLANT SCIENCE, 2023, 卷号: 14, 页码: 1166140
作者:
Qu,Xiao-Jian
;
Zou,Dan
;
Zhang,Rui-Yu
;
Stull,Gregory W.
;
Yi,Ting-Shuang
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提交时间:2024/05/09
annotation standards
chloroplast genome
plastome
protein structure
pseudogenes
RNA-editing genes
MITOCHONDRIAL GENES
RNA
GENOME
SEQUENCE
CHLOROPLASTS
TRANSLATION