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Dynamics of imprinted genes and their epigenetic mechanisms in castor bean seed with persistent endosperm
期刊论文
NEW PHYTOLOGIST, 2023, 卷号: 240, 期号: 5, 页码: 1868-1882
作者:
Han,Bing
;
Li,Yelan
;
Wu,Di
;
Li,De-Zhu
;
Liu,Aizhong
;
Xu,Wei
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提交时间:2024/07/10
castor bean
DNA methylation
endosperm
epigenetic mechanisms
genomic imprinting
histone modifications
DNA METHYLATION
ARABIDOPSIS
EXPRESSION
EVOLUTION
PROTEIN
PLANTS
CONSERVATION
DEMETER
PHERES1
COAT
R-loopAtlas: An integrated R-loop resource from 254 plant species sustained by a deep-learningbased tool
期刊论文
MOLECULAR PLANT, 2023, 卷号: 16, 期号: 3, 页码: 493-496
作者:
Li,Kuan
;
Wu,Zhenzhen
;
Zhou,Jincong
;
Xu,Wei
;
Li,Ling
;
Liu,Chao
;
Li,Wei
;
Zhang,Chengjun
;
Sun,Qianwen
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提交时间:2024/07/25
Epigenetic regulation of seed-specific gene expression by DNA methylation valleys in castor bean
期刊论文
BMC BIOLOGY, 2022, 卷号: 20, 期号: 1, 页码: 57
作者:
Han, Bing
;
Wu, Di
;
Zhang, Yanyu
;
Li, De-Zhu
;
Xu, Wei
;
Liu, Aizhong
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提交时间:2024/04/30
Seed-specific genes
DNA methylation valleys
Histone modifications
Enhancer
Castor bean
RICINUS-COMMUNIS L.
CENTRAL CELL
ARABIDOPSIS
EMBRYOGENESIS
TRANSCRIPTION
ENDOSPERM
IDENTIFICATION
ACCUMULATION
PLANTS
OIL
Single-base methylome analysis reveals dynamic changes of genome-wide DNA methylation associated with rapid stem growth of woody bamboos
期刊论文
PLANTA, 2022, 卷号: 256, 期号: 3, 页码: 53
作者:
Niu, Liang-Zhong
;
Xu, Wei
;
Ma, Peng-Fei
;
Guo, Zhen-Hua
;
Li, De-Zhu
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提交时间:2024/04/30
DNA methylation
Gene expression
Internode elongation
Jasmonic acid
Woody bamboos
PHENYLALANINE AMMONIA-LYASE
MOLECULAR CHARACTERIZATION
CYTOSINE METHYLTRANSFERASE
INTERNODE ELONGATION
TRANSCRIPTION FACTOR
H3 LYSINE-9
ARABIDOPSIS
EXPRESSION
DEMETHYLATION
PROTEIN
Genome-wide analysis of the B3 transcription factors reveals that RcABI3/VP1 subfamily plays important roles in seed development and oil storage in castor bean (Ricinus communis)
期刊论文
PLANT DIVERSITY, 2022, 卷号: 44, 期号: 2, 页码: 201-212
作者:
Wang, Wen-Bo
;
Ao, Tao
;
Zhang, Yan-Yu
;
Wu, Di
;
Xu, Wei
;
Han, Bing
;
Liu, Ai-Zhong
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提交时间:2024/04/30
B3 transcription factor
Castor bean
Gene expression
ABI3
VP1 subfamily
Seed development
Seed oil
EMBRYO DEVELOPMENT
LEAFY COTYLEDON2
ARABIDOPSIS RAV1
DOMAIN
MATURATION
PROTEIN
GENES
REGULATOR
SEQUENCE
GERMINATION
Metabolomic and transcriptomic analyses reveal new insights into the role of abscisic acid in modulating mango fruit ripening
期刊论文
HORTICULTURE RESEARCH, 2022, 卷号: 9, 页码: uhac102
作者:
Wu, Shibo
;
Wu, Di
;
Song, Juan
;
Zhang, Yanyu
;
Tan, Qing
;
Yang, Tianquan
;
Yang, Jingya
;
Wang, Songbiao
;
Xu, Jianchu
;
Xu, Wei
;
Liu, Aizhong
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提交时间:2024/03/11
Genomic insights into the origin, domestication and genetic basis of agronomic traits of castor bean
期刊论文
GENOME BIOLOGY, 2021, 卷号: 22, 期号: 1, 页码: 113
作者:
Xu,Wei
;
Wu,Di
;
Yang,Tianquan
;
Sun,Chao
;
Wang,Zaiqing
;
Han,Bing
;
Wu,Shibo
;
Yu,Anmin
;
Chapman,Mark A.
;
Muraguri,Sammy
;
Tan,Qing
;
Wang,Wenbo
;
Bao,Zhigui
;
Liu,Aizhong
;
Li,De-Zhu
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提交时间:2022/04/02
Genomic evolution
Domestication
Population genetics
GWAS
Castor bean
SINGLE NUCLEOTIDE POLYMORPHISMS
SEED SIZE
PHYLOGENETIC ANALYSIS
CELL ELONGATION
PLANT-GROWTH
ARABIDOPSIS
ANNOTATION
PROVIDES
YIELD
TOOL
Bulked segregant analysis reveals candidate genes responsible for dwarf formation in woody oilseed crop castor bean
期刊论文
SCIENTIFIC REPORTS, 2021, 卷号: 11, 期号: 1, 页码: 6277
作者:
Wang,Zaiqing
;
Yu,Anmin
;
Li,Fei
;
Xu,Wei
;
Han,Bing
;
Cheng,Xiaomao
;
Liu,Aizhong
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提交时间:2022/04/02
AUXIN TRANSPORT
CELL-WALL
ENDOPLASMIC-RETICULUM
PLANT HEIGHT
ARABIDOPSIS
HOMEOSTASIS
PROTEIN
BIOSYNTHESIS
ENCODES
SYSTEM
Blue genome: chromosome-scale genome reveals the evolutionary and molecular basis of indigo biosynthesis in Strobilanthes cusia
期刊论文
PLANT JOURNAL, 2020
作者:
Xu, Wei
;
Zhang, Libin
;
Cunningham, Anthony B.
;
Li, Shan
;
Zhuang, Huifu
;
Wang, Yuhua
;
Liu, Aizhong
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提交时间:2021/01/05
Isolation and functional analyses of PvFAD2 and PvFAD3 involved in the biosynthesis of polyunsaturated fatty acids from Sacha Inchi (Plukenetia volubilis)
期刊论文
PEERJ, 2020
作者:
Yang, Tianquan
;
Wang, Xiaojuan
;
Dong, Tingnan
;
Xu, Wei
;
Liu, Aizhong
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提交时间:2021/01/05