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中国科学院昆明植物研究所知识管理系统
Knowledge Management System of Kunming Institute of Botany,CAS
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Comparative chloroplast genome analysis of Citrus (Rutaceae) species: Insights into genomic characterization, phylogenetic relationships, and discrimination of subgenera
期刊论文
SCIENTIA HORTICULTURAE, 2023, 卷号: 313, 页码: 111909
作者:
Shi,Wenbo
;
Song,Weicai
;
Liu,Jin
;
Shi,Chao
;
Wang,Shuo
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提交时间:2024/07/17
Citrus
Plastid genomics
Genomic structure
Sequence variation
Molecular markers
Phylogeny
Taxonomy
HORT. EX TANAKA
GENETIC DIVERSITY
MOLECULAR PHYLOGENY
SPACER REGION
JEJU ISLAND
SEQUENCE
DNA
ORIGIN
TAXONOMY
AURANTIOIDEAE
Home at last: Molecular phylogenetic analyses support subsuming Metastachydium within Phlomoides (Lamiaceae)
期刊论文
TAXON, 2023
作者:
Zhao,Yue
;
Zhao,Fei
;
Salmaki,Yasaman
;
Paton,Alan
;
Cai,Jie
;
Drew,Bryan T.
;
Mahmoudi,Chonour
;
Efimov,Petr
;
Turginov,Orzimat T.
;
Liang,Cun-Zhu
;
Chen,Ya-Ping
;
Xiang,Chun-Lei
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提交时间:2024/07/10
Central Asia
Lamioideae
nrITS
Phlomideae
Phlomis
plastome phylogenomics
COMPLETE CHLOROPLAST GENOME
PLASTID DNA
LEPECHINIA LAMIACEAE
LAMIOIDEAE LAMIACEAE
CHARACTER EVOLUTION
NUCLEAR
CLASSIFICATION
POSITION
ORIGIN
GENERA
Characteristics of plastid genomes in the genus Ceratostigma inhabiting arid habitats in China and their phylogenomic implications
期刊论文
BMC PLANT BIOLOGY, 2023, 卷号: 23, 期号: 1, 页码: 303
作者:
Zhao,Yu-Juan
;
Liu,Jian
;
Yin,Gen-Shen
;
Gong,Xun
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提交时间:2024/05/09
Ceratostigma
Plastid genome
Comparative analysis
Interspecific relationship
Plumbaginaceae
COMPLETE CHLOROPLAST GENOME
MEKONG-SALWEEN DIVIDE
LIMONIUM-SINENSE
INVERTED REPEAT
SEQUENCE
EVOLUTION
DNA
PLUMBAGINACEAE
CONSEQUENCES
DIVERSITY
Plastome phylogenomics and morphological traits analyses provide new insights into the phylogenetic position, species delimitation and speciation of Triplostegia (Caprifoliaceae)
期刊论文
BMC PLANT BIOLOGY, 2023, 卷号: 23, 期号: 1, 页码: 645
作者:
Fu,Qing-Li
;
Mo,Zhi-Qiong
;
Xiang,Xiao-Guo
;
Milne,Richard I.
;
Jacquemyn,Hans
;
Burgess,Kevin S.
;
Sun,Ya-Nan
;
Yan,Hua
;
Qiu,Li
;
Yang,Bo-Yun
;
Tan,Shao-Lin
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提交时间:2024/05/09
Plastid genome
Phylogenomics
Speciation
Species delimitation
Triplostegia
FOREST DYNAMICS PLOT
HENGDUAN MOUNTAINS
ELEVATIONAL GRADIENT
SYSTEMATIC POSITION
RIVERINE BARRIER
DNA BARCODES
PLANT
DIPSACALES
SEQUENCE
DIVERSITY
Do taxon-specific DNA barcodes improve species discrimination relative to universal barcodes in Lauraceae?
期刊论文
BOTANICAL JOURNAL OF THE LINNEAN SOCIETY, 2022, 卷号: 199, 期号: 4, 页码: 741-753
作者:
Liu, Zhi-Fang
;
Ma, Hui
;
Zhang, Xiao-Yan
;
Ci, Xiu-Qin
;
Li, Lang
;
Hu, Jian-Lin
;
Zhang, Can-Yu
;
Xiao, Jian-Hua
;
Li, His-Wen
;
Conran, John G.
;
Twyford, Alex D.
;
Hollingsworth, Peter M.
;
Li, Jie
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提交时间:2024/04/30
DNA barcoding
ITS
phylogenetics
plastid DNA
specific barcode design
CHLOROPLAST GENOME
LAND PLANTS
GENE
WOOD
PHYLOGENY
FAGACEAE
FAILURE
Highly degenerate plastomes in two hemiparasitic dwarf mistletoes: Arceuthobium chinense and A. pini (Viscaceae)
期刊论文
PLANTA, 2021, 卷号: 253, 期号: 6, 页码: 125
作者:
Guo,Xiaorong
;
Zhang,Guangfei
;
Fan,Linyuan
;
Liu,Changkun
;
Ji,Yunheng
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提交时间:2022/04/02
Endophytic habit
Reductive evolution
Rpo genes
rpl33
Gene loss
Santalales
COMPLETE CHLOROPLAST GENOME
PLASTID GENOME
NDH GENES
PHYSIOLOGICAL-ASPECTS
EVOLUTIONARY RATE
DNA BARCODE
LIFE-STYLE
SEQUENCE
ORGANIZATION
LORANTHACEAE
Systematic Placement of the Enigmatic Southeast Asian Genus Paralamium and an Updated Phylogeny of Tribe Pogostemoneae (Lamiaceae Subfamily Lamioideae)
期刊论文
FRONTIERS IN PLANT SCIENCE, 2021, 卷号: 12, 页码: 646133
作者:
Zhao,Fei
;
Wu,Yi-Wen
;
Drew,Bryan T.
;
Yao,Gang
;
Chen,Ya-Ping
;
Cai,Jie
;
Liu,En-De
;
Li,Bo
;
Xiang,Chun-Lei
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提交时间:2022/04/02
Lamioideae
molecular phylogenetics
nutlet morphology
plastome phylogenomics
Paralamium
Pogostemoneae
MOLECULAR PHYLOGENETICS
CHARACTER EVOLUTION
PERICARP STRUCTURE
PLASTID DNA
LEPECHINIA LAMIACEAE
POLLEN MORPHOLOGY
NUCLEAR
CLASSIFICATION
PHLOMOIDES
GENERA
Resolving robust phylogenetic relationships of core Brassicaceae using genome skimming data
期刊论文
JOURNAL OF SYSTEMATICS AND EVOLUTION, 2021, 卷号: 59, 期号: 3, 页码: 442-453
作者:
Liu,Liang-Min
;
Du,Xin-Yu
;
Guo,Cen
;
Li,De-Zhu
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提交时间:2022/04/02
core Brassicaceae
incongruence
nuclear ribosome DNA
plastid genome
MOLECULAR PHYLOGENY
CHLOROPLAST
TRIBE
BLOCKS
CHORISPOREAE
SYSTEMATICS
ANNOTATION
GENERATION
EVOLUTION
SELECTION
Evolutionary history and biogeography of Mandragora L. (Solanaceae)
期刊论文
MOLECULAR PHYLOGENETICS AND EVOLUTION, 2018, 卷号: 129, 期号: 1, 页码: 85-95
作者:
Volis, Sergei
;
Fogel, Keren
;
Tu, Tieyao
;
Sun, Hang
;
Zaretsky, Marianna
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提交时间:2018/11/12
Mandragora
Phylogeny
Biogeography
Plastid Dna
Its
Human-assisted Migration
Genome skimming herbarium specimens for DNA barcoding and phylogenomics
期刊论文
PLANT METHODS, 2018, 卷号: 14, 页码: 43
作者:
Zeng, Chun-Xia
;
Hollingsworth, Peter M.
;
Yang, Jing
;
He, Zheng-Shan
;
Zhang, Zhi-Rong
;
Li, De-Zhu
;
Yang, Jun-Bo
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提交时间:2018/07/16
Degraded Dna
Herbarium Specimens
Genome Skimming
Plastid Genome
Rdna
Dna Barcoding