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Editorial: Rise to the challenges in plastome phylogenomics
期刊论文
FRONTIERS IN PLANT SCIENCE, 2023, 卷号: 14, 页码: 1200302
作者:
Dong,Wenpan
;
Gao,Lianming
;
Xu,Chao
;
Song,Yu
;
Poczai,Peter
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提交时间:2024/05/09
plastome phylogenomics
incomplete lineage sorting
introgression
species tree
phylogenetic discordance
Multi-locus phylogeny of Bryoria reveals recent diversification and unexpected diversity in section Divaricatae
期刊论文
LICHENOLOGIST, 2023
作者:
Myllys,Leena
;
Pino-Bodas,Raquel
;
Velmala,Saara
;
Wang,Li-Song
;
Goward,Trevor
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提交时间:2024/07/30
fungal barcode
incomplete lineage sorting
ITS regions
lichen
species delimitation
SPECIES DELIMITATION
PCR PRIMERS
PARMELIACEAE
ASCOMYCOTA
DNA
EVOLUTION
TAXONOMY
LICHENS
USNEA
LECANORALES
Phylogeny and evolution of Asparagaceae subfamily Nolinoideae: new insights from plastid phylogenomics
期刊论文
ANNALS OF BOTANY, 2022
作者:
Ji, Yunheng
;
Landis, Jacob B.
;
Yang, Jin
;
Wang, Shuying
;
Zhou, Nian
;
Luo, Yan
;
Liu, Haiyang
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提交时间:2024/04/30
Ancient hybridization
Convallarieae
incomplete lineage sorting
plastome
phylogeny
Polygonateae
Theropogon
RUSCACEAE SENSU-LATO
CHROMOSOME EVOLUTION
DIVERSIFICATION
FAMILIES
GENES
CLASSIFICATION
COMBINATIONS
ANGIOSPERMS
RESOLVES
PLATFORM
Phylogenomics and the flowering plant tree of life
期刊论文
JOURNAL OF INTEGRATIVE PLANT BIOLOGY, 2022
作者:
Guo, Cen
;
Luo, Yang
;
Gao, Lian-Ming
;
Yi, Ting-Shuang
;
Li, Hong-Tao
;
Yang, Jun-Bo
;
Li, De-Zhu
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提交时间:2024/08/21
angiosperms
hybridization
incomplete lineage sorting
orthology inference
phylogenetic conflicts
reduced representation sequencing
whole-genome sequencing
whole-genome duplication
SYSTEMATIC-ERRORS
RNA-SEQ
SEQUENCE CAPTURE
SEED PLANTS
DATA SETS
GENOME
EVOLUTION
RADSEQ
TOOL
CLASSIFICATION
Using nuclear loci and allelic variation to disentangle the phylogeny of Phyllostachys (Poaceae, Bambusoideae)
期刊论文
MOLECULAR PHYLOGENETICS AND EVOLUTION, 2019, 卷号: 137, 页码: 222-235
作者:
Zhang, Li-Na
;
Ma, Peng-Fei
;
Zhang, Yu-Xiao
;
Zeng, Chun-Xia
;
Zhao, Lei
;
Li, De-Zhu
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提交时间:2019/07/29
Alleles
Bamboo
Hybridization
Incomplete lineage sorting
Monophyly
Phylogenetic inference
Complex evolution in Arundinarieae (Poaceae: Bambusoideae): Incongruence between plastid and nuclear GBSSI gene phylogenies
期刊论文
MOLECULAR PHYLOGENETICS AND EVOLUTION, 2012, 卷号: 63, 期号: 3, 页码: 777-797
作者:
Zhang, Yu-Xiao
;
Zeng, Chun-Xia
;
Li, De-Zhu
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提交时间:2014/04/02
Arundinarieae
Gbssi Gene
Hybridization
Incongruence
Lineage Sorting
Plastid Dna Regions
Phylogeny of Nolana (Solanaceae) of the Atacama and Peruvian deserts inferred from sequences of four plastid markers and the nuclear LEAFY second intron
期刊论文
MOLECULAR PHYLOGENETICS AND EVOLUTION, 2008, 卷号: 49, 期号: 2, 页码: 561-573
作者:
Tu, Tieyao
;
Dillon, Michael O.
;
Sun, Hang
;
Wen, Jun
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提交时间:2011/12/06
Gene Duplication
Lineage Sorting
Ndhf
Psba-trnh
Reticulate Evolution
Rps16-trnk
Trnc-psbm