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Comparative chloroplast genome analyses of diverse Phoebe (Lauraceae) species endemic to China provide insight into their phylogeographical origin
期刊论文
PEERJ, 2023, 卷号: 11, 页码: e14573
作者:
Shi,Wenbo
;
Song,Weicai
;
Chen,Zimeng
;
Cai,Haohong
;
Gong,Qin
;
Liu,Jin
;
Shi,Chao
;
Wang,Shuo
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提交时间:2024/07/17
Phoebe
Chloroplast genome
Comparative analysis
Phylogeny
Phylogeographical origin
Conservation
POLYMORPHISM ANALYSIS
SEQUENCE
DNA
ANNOTATION
REGION
TOOLS
Deep reticulation: the long legacy of hybridization in vascular plant evolution
期刊论文
PLANT JOURNAL, 2023, 卷号: 114, 期号: 4, 页码: 743-766
作者:
Stull,Gregory W.
;
Pham,Kasey K.
;
Soltis,Pamela S.
;
Soltis,Douglas E.
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提交时间:2024/07/10
ancient hybridization
gene flow
phylogenomics
polyploidy
reticulation
vascular plants
CHLOROPLAST DNA
GENE FLOW
HYBRID SPECIATION
ANGIOSPERM DIVERSIFICATION
NATURAL HYBRIDIZATION
PHYLOGENETIC ANALYSES
SEED PLANTS
WHITE OAKS
SCALE DATA
POLYPLOIDY
Home at last: Molecular phylogenetic analyses support subsuming Metastachydium within Phlomoides (Lamiaceae)
期刊论文
TAXON, 2023
作者:
Zhao,Yue
;
Zhao,Fei
;
Salmaki,Yasaman
;
Paton,Alan
;
Cai,Jie
;
Drew,Bryan T.
;
Mahmoudi,Chonour
;
Efimov,Petr
;
Turginov,Orzimat T.
;
Liang,Cun-Zhu
;
Chen,Ya-Ping
;
Xiang,Chun-Lei
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提交时间:2024/07/10
Central Asia
Lamioideae
nrITS
Phlomideae
Phlomis
plastome phylogenomics
COMPLETE CHLOROPLAST GENOME
PLASTID DNA
LEPECHINIA LAMIACEAE
LAMIOIDEAE LAMIACEAE
CHARACTER EVOLUTION
NUCLEAR
CLASSIFICATION
POSITION
ORIGIN
GENERA
Multiple paternally inherited chloroplast capture events associated with Taxus speciation in the Hengduan Mountains
期刊论文
MOLECULAR PHYLOGENETICS AND EVOLUTION, 2023, 卷号: 189, 页码: 107915
作者:
Qin,Han-Tao
;
Moller,Michael
;
Milne,Richard
;
Luo,Ya-Huang
;
Zhu,Guang-Fu
;
Li,De-Zhu
;
Liu,Jie
;
Gao,Lian-Ming
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提交时间:2024/07/25
Chloroplast capture
Genomic data
Hybridization
Hengduan Mountains
Phylogeny tree discordance
Taxus
POPULATION-SIZE CHANGES
TIBETAN PLATEAU MARGIN
CYTOPLASMIC INHERITANCE
HYBRID SPECIATION
GENETIC DIVERSITY
PINUS-DENSATA
R PACKAGE
TOOL SET
HYBRIDIZATION
BIODIVERSITY
A clue to the evolutionary history of modern East Asian flora: Insights from phylogeography and diterpenoid alkaloid distribution pattern of the Spiraea japonica complex
期刊论文
MOLECULAR PHYLOGENETICS AND EVOLUTION, 2023, 卷号: 184, 页码: 107772
作者:
Luo,Dong
;
Song,Min-shu
;
Xu,Bo
;
Zhang,Yu
;
Zhang,Jian-wen
;
Ma,Xiang-guang
;
Hao,Xiao jiang
;
Sun,Hang
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提交时间:2024/07/25
ampliative Spiraea japonica complex
East Asian flora
Transition belt
Phylogeography
Diterpenoid alkaloids
MOLECULAR PHYLOGEOGRAPHY
SECONDARY METABOLITES
HENGDUAN MOUNTAINS
QUATERNARY CLIMATE
PLANT DIVERSITY
ROSACEAE
DNA
CHLOROPLAST
COALESCENT
CHINA
Complete chloroplast genomes of four Atalantia (Rutaceae) species: insights into comparative analysis, phylogenetic relationships, and divergence time estimation
期刊论文
PLANT SYSTEMATICS AND EVOLUTION, 2023, 卷号: 309, 期号: 5, 页码: 31
作者:
Shi,Wenbo
;
Song,Weicai
;
Zhao,Yuqi
;
Shi,Chao
;
Wang,Shuo
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提交时间:2024/05/09
Atalantia
Chloroplast genome
Comparative analysis
Divergence times
Molecular markers
Phylogeny
ACETYL-COA CARBOXYLASE
CITRUS
SEQUENCE
AURANTIOIDEAE
EVOLUTION
DIVERSITY
FOSSIL
DNA
BIOGEOGRAPHY
RADIATIONS
Characterization of the complete chloroplast genome of Amsonia elliptica (Apocynaceae)
期刊论文
MITOCHONDRIAL DNA PART B-RESOURCES, 2023, 卷号: 8, 期号: 3, 页码: 461-465
作者:
Kim,Yongsung
;
Nam,Bo-Mi
;
Kim,Iseon
;
Deng,Tao
;
Kim,Changkyun
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提交时间:2024/05/09
Amsonia elliptica
Apocynaceae
chloroplast genome
endangered species
phylogenomic analyses
PLASTOME SEQUENCE
CHOICE
The complete chloroplast genome of Pseudotsuga sinensis, a China endemic species
期刊论文
MITOCHONDRIAL DNA PART B-RESOURCES, 2023, 卷号: 8, 期号: 1, 页码: 23-25
作者:
Li,Wang Jun
;
Feng,Tu
;
Li,Jun
;
He,Bin
;
Zou,Shun
;
Liu,Peng Ju
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提交时间:2024/05/09
Pseudotsuga sinensis
chloroplast genome
phylogeny
Uncovering the first complete chloroplast genomics, comparative analysis, and phylogenetic relationships of the medicinal plants Rhamnus cathartica and Frangula alnus (Rhamnaceae)
期刊论文
PHYSIOLOGY AND MOLECULAR BIOLOGY OF PLANTS, 2023, 卷号: 29, 期号: 6, 页码: 855-869
作者:
Shi,Wenbo
;
Hu,Siqi
;
Song,Weicai
;
Huang,Yahui
;
Shi,Chao
;
Wang,Shuo
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提交时间:2024/05/09
Rhamnus
Frangula alnus
Chloroplast genome
Comparative analysis
Divergence
Phylogenetic analysis
PHOTOSYSTEM-II
SEQUENCE
DNA
EVOLUTION
NUCLEAR
ORGANIZATION
POPULATIONS
DIVERSITY
GENES
PSBL
Characteristics of plastid genomes in the genus Ceratostigma inhabiting arid habitats in China and their phylogenomic implications
期刊论文
BMC PLANT BIOLOGY, 2023, 卷号: 23, 期号: 1, 页码: 303
作者:
Zhao,Yu-Juan
;
Liu,Jian
;
Yin,Gen-Shen
;
Gong,Xun
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提交时间:2024/05/09
Ceratostigma
Plastid genome
Comparative analysis
Interspecific relationship
Plumbaginaceae
COMPLETE CHLOROPLAST GENOME
MEKONG-SALWEEN DIVIDE
LIMONIUM-SINENSE
INVERTED REPEAT
SEQUENCE
EVOLUTION
DNA
PLUMBAGINACEAE
CONSEQUENCES
DIVERSITY