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An updated classification for the hyper-diverse genus Corydalis (Papaveraceae: Fumarioideae) based on phylogenomic and morphological evidence 期刊论文
JOURNAL OF INTEGRATIVE PLANT BIOLOGY, 2023
作者:  Chen,Jun-Tong;  Liden,Magnus;  Huang,Xian-Han;  Zhang,Liang;  Zhang,Xin-Jian;  Kuang,Tian-Hui;  Landis,Jacob B.;  Wang,Dong;  Deng,Tao;  Sun,Hang
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character evolution  Corydalis  genome skimming  Papaveraceae  phylogeny  FUMARIACEAE  EVOLUTIONARY  HIMALAYA  HUBEI  
Phylogenomics and morphological evolution of the mega-diverse genus Artemisia (Asteraceae: Anthemideae): implications for its circumscription and infrageneric taxonomy 期刊论文
ANNALS OF BOTANY, 2023, 卷号: 131, 期号: 5, 页码: 867-883
作者:  Jiao,Bohan;  Chen,Chen;  Wei,Meng;  Niu,Guohao;  Zheng,Jiye;  Zhang,Guojin;  Shen,Jiahao;  Vitales,Daniel;  Valles,Joan;  Verloove,Filip;  Erst,Andrey S.;  Soejima,Akiko;  Mehregan,Iraj;  Kokubugata,Goro;  Chung,Gyu-Young;  Ge,Xuejun;  Gao,Lianming;  Yuan,Yuan;  Joly,Cyprien;  Jabbour,Florian;  Wang,Wei;  Shultz,Leila M.;  Gao,Tiangang
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Artemisia  phylogenomics  taxonomy  morphological evolution  generic delimitation  infrageneric taxonomy  genome skimming  NUCLEAR RIBOSOMAL DNA  MOLECULAR PHYLOGENY  SUBGENUS TRIDENTATAE  ALLIES ANTHEMIDEAE  ENDEMIC ARTEMISIA  TREE  L.  CLASSIFICATION  GENERA  ORIGIN  
Deciphering complex reticulate evolution of Asian Buddleja (Scrophulariaceae): insights into the taxonomy and speciation of polyploid taxa in the Sino-Himalayan region 期刊论文
ANNALS OF BOTANY, 2023
作者:  Yang,Fengmao;  Ge,Jia;  Guo,Yongjie;  Olmstead,Richard;  Sun,Weibang
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Buddleja  phylogenomics  reticulate evolution  polyploidy  plastid genome  low-copy nuclear gene  HYBRIDIZATION  ALIGNMENT  DIVERSIFICATION  ALLOPOLYPLOIDY  PHYLOGENETICS  FRAMEWORK  NUCLEAR  ROBUST  FLOW  
Genome skimming as an efficient tool for authenticating commercial products of the pharmaceutically important Paris yunnanensis (Melanthiaceae) 期刊论文
BMC PLANT BIOLOGY, 2023, 卷号: 23, 期号: 1, 页码: 344
作者:  Zhou,Nian;  Tang,Lilei;  Xie,Pingxuan;  Miao,Ke;  Yang,Chengjin;  Liu,Haiyang;  Ji,Yunheng
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Plastome  Rhizoma Paridis  Ribosomal DNA  Species identification  DNA BARCODE  IQ-TREE  CONSERVATION  IDENTIFICATION  OPPORTUNITIES  RENAISSANCE  CULTIVATION  PERFORMANCE  LIBRARY  FOREST  
Testing complete plastomes and nuclear ribosomal DNA sequences for species identification in a taxonomically difficult bamboo genus Fargesia 期刊论文
PLANT DIVERSITY, 2023, 卷号: 45, 期号: 2, 页码: 147-155
作者:  Lv,Shi-Yu;  Ye,Xia-Ying;  Li,Zhong-Hu;  Ma,Peng-Fei;  Li,De-Zhu
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Fargesia  Genome-skimming  DNA barcoding  Plastome  Ribosomal DNA  WHOLE CHLOROPLAST GENOMES  RNA-SEQ DATA  ARUNDINARIEAE POACEAE  BAMBUSOIDEAE  TEMPERATE  PLATFORM  
Phylogenetic Relationships and Next-Generation Barcodes in the Genus Torreya Reveal a High Proportion of Misidentified Cultivated Plants 期刊论文
INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES, 2023, 卷号: 24, 期号: 17, 页码: 13216
作者:  Mo,Zhi-Qiong;  Wang,Jie;  Moller,Michael;  Yang,Jun-Bo;  Gao,Lian-Ming
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Torreya  genome skimming  species identification  phylogeny  COMPLETE CHLOROPLAST GENOME  SEQUENCE  TAXACEAE  CEPHALOTAXACEAE  DIVERSIFICATION  PHYLOGENOMICS  INFERENCE  ALIGNMENT  ZHEJIANG  ACCURATE  
Testing and using complete plastomes for authentication of medicinal Polygonatum species (Asparagaceae) 期刊论文
INDUSTRIAL CROPS AND PRODUCTS, 2023, 卷号: 197, 页码: 116557
作者:  Wang,Shuying;  Zhou,Nian;  Shi,Naixing;  Zhang,Guangfei;  Liu,Haiyang;  Guo,Xiaorong;  Ji,Yunheng
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Adulterant  Genome skimming  Plant barcoding 2  0  Polygonati Rhizoma  Species identification  DNA BARCODE  IQ-TREE  GENOMES  REINSTATEMENT  
唇形科叶绿体系统发育基因组学研究 ——兼论假野芝麻属的系统学位置 学位论文
: 中国科学院大学, 2022
作者:  赵飞
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唇形科，野芝麻亚科，假野芝麻属，族间关系，系统发育基因组学  Lamiaceae, Lamioideae, Paralamium, tribe relationships, phylogenomic  
桔梗亚科的分子系统发育和生物地理学研究 -兼论细胞器基因组编码区的替代速率模式与机制 学位论文
: 中国科学院大学, 2022
作者:  李春姣
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桔梗亚科，浅层测序技术，系统发育基因组学，核糖体 DNA，细胞 器基因组，生物地理学，编码区，替代速率，突变速率  Campanuloideae, genome skimming, phylogenomics, nuclear ribosomal DNA, organelle genome, biogeography, coding region, substitution rate, mutation rate  
箭竹属的 DNA 条形码研究 学位论文
: 中国科学院大学, 2022
作者:  吕时雨
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箭竹属， 浅层测序， DNA条形码， 叶绿体基因组， 核糖体DNA  Fargesia, genome-skimming, DNA barcoding, plastome, ribosomal DNA