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中国科学院昆明植物研究所知识管理系统
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Progress, challenge and prospect of plant plastome annotation
期刊论文
FRONTIERS IN PLANT SCIENCE, 2023, 卷号: 14, 页码: 1166140
作者:
Qu,Xiao-Jian
;
Zou,Dan
;
Zhang,Rui-Yu
;
Stull,Gregory W.
;
Yi,Ting-Shuang
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提交时间:2024/05/09
annotation standards
chloroplast genome
plastome
protein structure
pseudogenes
RNA-editing genes
MITOCHONDRIAL GENES
RNA
GENOME
SEQUENCE
CHLOROPLASTS
TRANSLATION
Plastid RNA editing reduction accompanied with genetic variations in Cymbidium, a genus with diverse lifestyle modes
期刊论文
PLANT DIVERSITY, 2022, 卷号: 44, 期号: 3, 页码: 316-321
作者:
Zhe, Mengqing
;
Zhang, Le
;
Liu, Fang
;
Huang, Yiwei
;
Fan, Weishu
;
Yang, Junbo
;
Zhu, Andan
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提交时间:2022/07/15
RNA editing
Plastomes
ndh genes
Lifestyle
Plastid RNA editing reduction accompanied with genetic variations in Cymbidium, a genus with diverse lifestyle modes
期刊论文
PLANT DIVERSITY, 2022, 卷号: 44, 期号: 3, 页码: 316-321
作者:
Zhe, Mengqing
;
Zhang, Le
;
Liu, Fang
;
Huang, Yiwei
;
Fan, Weishu
;
Yang, Junbo
;
Zhu, Andan
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提交时间:2024/04/30
RNA editing
Plastomes
ndh genes
Lifestyle
CRASSULACEAN ACID METABOLISM
ORCHIDACEAE
ALIGNMENT
GENOME
Organelle Genomes and Transcriptomes of Nymphaea Reveal the Interplay between Intron Splicing and RNA Editing
期刊论文
INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES, 2021, 卷号: 22, 期号: 18, 页码: 9842
作者:
He,Zheng-Shan
;
Zhu,Andan
;
Yang,Jun-Bo
;
Fan,Weishu
;
Li,De-Zhu
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提交时间:2022/04/02
Nymphaea
organelle genomes
transcriptomes
intron splicing
RNA editing
MESSENGER-RNA
PLANT-MITOCHONDRIA
WHEAT
CHLOROPLASTS
ACCURATE
SITES
EXPRESSION
EVOLUTION
ALIGNMENT
PROTEINS
Organellomic data sets confirm a cryptic consensus on (unrooted) land-plant relationships and provide new insights into bryophyte molecular evolution
期刊论文
AMERICAN JOURNAL OF BOTANY, 2020, 卷号: 107, 期号: 1, 页码: 126-138
作者:
Del Rio, Cedric
;
Wang, Teng-Xiang
;
Liu, Jia
;
Liang, Shui-Qing
;
Spicer, Robert A.
;
Wu, Fei-Xiang
;
Zhou, Zhe-Kun
;
Su, Tao
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提交时间:2020/03/18
Anthocerotophyta (hornworts)
Bryophyta (mosses)
embryophyte relationships
long-branch outgroups
Marchantiophyta (liverworts)
mycoheterotrophic bryophytes
organellar evolution
phylogenetic incongruence
RNA editing
tree rooting
Mitochondrial genome from Andreaea wangiana reveals structural conservatism and a trend of size reduction in mosses
期刊论文
BRYOLOGIST, 2019, 卷号: 122, 期号: 4, 页码: 597-606
作者:
Huang, Wen-Zhuan
;
Ma, Wen-Zhang
;
Schneider, Harald
;
Yu, Ying
;
Wu, Yu-Huan
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提交时间:2020/03/26
Andreaeaceae
reduction of mitogenome size
RNA editing sites
Setaphyta
simple repeat sequence
structural conservatism
Complete loss of RNA editing from the plastid genome and most highly expressed mitochondrial genes of Welwitschia mirabilis
期刊论文
SCIENCE CHINA-LIFE SCIENCES, 2019, 卷号: 62, 期号: 4, 页码: 498-506
作者:
Fan, Weishu
;
Guo, Wenhu
;
Funk, Lexis
;
Mower, Jeffrey P.
;
Zhu, Andan
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提交时间:2019/07/29
RNA editing
massive loss
expression levels
organelle genomes
Welwitschia
Complete chloroplast genome sequence of Magnolia kwangsiensis (Magnoliaceae): implication for DNA barcoding and population genetics
期刊论文
GENOME, 2011, 卷号: 54, 期号: 8, 页码: 663-673
作者:
Kuang, Dai-Yong
;
Wu, Hong
;
Wang, Ya-Ling
;
Gao, Lian-Ming
;
Zhang, Shou-Zhou
;
Lu, Lu
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提交时间:2012/03/16
Magnolia Kwangsiensis
Plastome
Dna Barcoding
Cpssr
Rna Editing