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Characterizing conflict and congruence of molecular evolution across organellar genome sequences for phylogenetics in land plants 期刊论文
FRONTIERS IN PLANT SCIENCE, 2023, 卷号: 14, 页码: 1125107
作者:  Tyszka,Alexa S.;  Bretz,Eric C.;  Robertson,Holly M.;  Woodcock-Girard,Miles D.;  Ramanauskas,Karolis;  Larson,Drew A.;  Stull,Gregory W.;  Walker,Joseph F.
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phylogenetics  plastome  mitochondrial genome  chloroplast genome  phylogenomics  combinability  phylogenetic conflict  MITOCHONDRIAL GENOMES  PENALIZED LIKELIHOOD  NUCLEOTIDE-SEQUENCES  EXTANT GYMNOSPERMS  DYNAMIC EVOLUTION  CHLOROPLAST DNA  SEED PLANTS  GENE  RATES  RECOMBINATION  
Plastome characteristics and species identification of Chinese medicinal wintergreens (Gaultheria, Ericaceae) 期刊论文
PLANT DIVERSITY, 2022, 卷号: 44, 期号: 6, 页码: 519-529
作者:  Xu, Yan-Ling;  Shen, Hao-Hua;  Du, Xin-Yu;  Lu, Lu
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DNA barcodes  Gene duplication  Plastome  Repeat sequences  Structural variation  CHLOROPLAST GENOME  PHYLOGENETIC ANALYSIS  INVERTED REPEAT  EVOLUTION  SEQUENCE  DNA  SOFTWARE  INSIGHTS  REARRANGEMENTS  ORGANIZATION  
Phylogeny and evolution of chloroplast tRNAs in Adoxaceae 期刊论文
ECOLOGY AND EVOLUTION, 2021, 卷号: 11, 期号: 3, 页码: 1294-1309
作者:  Zhong,Qiu-Yi;  Fu,Xiao-Gang;  Zhang,Ting-Ting;  Zhou,Tong;  Yue,Ming;  Liu,Jian-Ni;  Li,Zhong-Hu
浏览  |  Adobe PDF(2392Kb)  |  收藏  |  浏览/下载：113/18  |  提交时间：2022/04/02
anticodon  chloroplast tRNA  intron  phylogeny  transition  transversion  NONOPTIMAL CODON USAGE  HORIZONTAL TRANSFER  GENE DUPLICATION  GENOME  MITOCHONDRIAL  ORIGIN  TRANSLATION  SEQUENCES  ACID  DNA  
Plastid phylogenomic analyses of Fagales reveal signatures of conflict and ancient chloroplast capture 期刊论文
MOLECULAR PHYLOGENETICS AND EVOLUTION, 2021, 卷号: 163, 页码: 107232
作者:  Yang,Ying-Ying;  Qu,Xiao-Jian;  Zhang,Rong;  Stull,Gregory W.;  Yi,Ting-Shuang
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Betulaceae  Juglandaceae  Myricaceae  Quercus  Phylogenetics  Chloroplast capture  RESTRICTION SITE VARIATION  INTERSPECIFIC GENE FLOW  DNA-SEQUENCES  EVOLUTIONARY HISTORY  MOLECULAR PHYLOGENY  CLADISTIC-ANALYSIS  SEED PLANTS  NUCLEAR  BETULACEAE  DIVERSIFICATION  
Rubellimicrobium rubrum sp. nov., a novel bright reddish bacterium isolated from a lichen sample 期刊论文
ANTONIE VAN LEEUWENHOEK INTERNATIONAL JOURNAL OF GENERAL AND MOLECULAR MICROBIOLOGY, 2019, 卷号: 112, 期号: 12, 页码: 1739-1745
作者:  Jiang, Long-Qian;  Zhang, Kun;  Li, Gui-Ding;  Wang, Xin-Yu;  Shi, Song-Biao;  Li, Qin-Yuan;  An, De-Feng;  Lang, Lei;  Wang, Li-Song;  Jiang, Cheng-Lin;  Jiang, Yi
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Rubellimicrobium rubrum  New species  Physcia sp  lichen  16S rRNA gene  Draft genome sequences  
A new species of Chaetothyrina on branches of mango, and introducing Phaeothecoidiellaceae fam. nov. 期刊论文
MYCOSPHERE, 2017, 卷号: 8, 期号: 1, 页码: 137-146
作者:  Hongsanan,S.;  Zhao,R. L.;  Hyde,K. D.
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Sooty Blotch  Flyspeck Complex  Maximum-likelihood  Gene-sequences  Fungi  Apple  China  Morphology  Diversity  Bootstrap  Capnodiales  Dothideomycetes  Flyspeck  Phylogeny  Sooty Blotch  
The timing and the mode of evolution of wild grapes (Vitis) 期刊论文
MOLECULAR PHYLOGENETICS AND EVOLUTION, 2012, 卷号: 62, 期号: 2, 页码: 736-747
Zecca, Giovanni; Abbott, J. Richard; Sun, Wei-Bang; Spada, Alberto; Sala, Francesco; Grassi, Fabrizio
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Vitis  Molecular Phylogeny  Hypothesis Testing  Divergence Time Estimate  Network  Tertiary-quaternary Debate  Grapes  Phylogenetic Tree Selection  Rpb2 Gene  Molecular Phylogeny  Flowering Plants  Dna-sequences  Mixed Models  Vitaceae  Diversity  Inference  Family  
Phylogeny of Rhus (Anacardiaceae) based on sequences of nuclear Nia-i3 intron and chloroplast trnC-trnD 期刊论文
SYSTEMATIC BOTANY, 2007, 卷号: 32, 期号: 2, 页码: 379-391
Yi, Tingshuang; Miller, Allison J.; Wen, Jun
Adobe PDF(323Kb)  |  收藏  |  浏览/下载：374/86  |  提交时间：2012/10/12
Anacardiaceae  Nia-i3  Phylogeny  Reticulate Evolution  Rhus  Trnc-trnd  Heuchera Group Saxifragaceae  Intergenic Region  Dna-sequences  Gene Trees  Plants  Inference  Utility  Hybridization  Substitution  Biogeography  
Phylogeny of Saururaceae inferred from matR sequence data 期刊论文
ACTA BOTANICA SINICA, 2001, 卷号: 43, 期号: 6, 页码: 653-656
作者:  Meng, SW;  Chen, ZD;  Li, DZ;  Liang, HX
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Saururaceae  Phylogeny  Matr Gene Sequences