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Rapid evolution of T2/S-RNase genes in Fragaria linked to multiple transitions from self-incompatibility to self-compatibility 期刊论文
PLANT DIVERSITY, 2023, 卷号: 45, 期号: 2, 页码: 219-228
作者:  Chen,Wu;  Wan,Hong;  Liu,Fang;  Du,Haiyuan;  Zhang,Chengjun;  Fan,Weishu;  Zhu,Andan
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Fragaria  RNase T2  Self-(in)compatibility  S-RNase  S-ALLELES  RNASE  RIBONUCLEASES  GENOME  PEAR  ARABIDOPSIS  DIVERSITY  SEQUENCE  IDENTIFICATION  TRANSCRIPTOME  
Marsdenia tenacissima genome reveals calcium adaptation and tenacissoside biosynthesis 期刊论文
PLANT JOURNAL, 2023, 卷号: 113, 期号: 6, 页码: 1146-1159
作者:  Zhou,Yanli;  Fan,Wei;  Zhang,Haoyue;  Zhang,Jingling;  Zhang,Guanghui;  Wang,Ding;  Xiang,Guisheng;  Zhao,Changhong;  Li,Lianhua;  He,Simei;  Lu,Yingchun;  Zhao,Jiuxia;  Meng,Zhengui;  Zhang,Xianmin;  Meng,Hengling;  Yin,Xinhua;  Yang,Shengchao;  Long,Guangqiang
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genome assembly  Hi-C  Apocynaceae  Ca2+ adaptation  cell-wall remodeling  Marsdenia tenacissima  CELL  GENES  TRANSCRIPTOME  MECHANISMS  ALIGNMENT  SOIL  
Multi-omics analysis reveals the evolutionary origin of diterpenoid alkaloid biosynthesis pathways in Aconitum 期刊论文
JOURNAL OF INTEGRATIVE PLANT BIOLOGY, 2023, 卷号: 65, 期号: 10, 页码: 2320-2335
作者:  Zhao,Dake;  Zhang,Ya;  Ren,Huanxing;  Shi,Yana;  Dong,Ding;  Li,Zonghang;  Cui,Guanghong;  Shen,Yong;  Mou,Zongmin;  Kennelly,Edward J.;  Huang,Luqi;  Ruan,Jue;  Chen,Suiyun;  Yu,Diqiu;  Cun,Yupeng
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Aconitum vilmorinianum  acute toxicity  biosynthetic pathway  diterpenoid alkaloid  evolutionary origin  genome assembly  PHYLOGENETIC ANALYSIS  SUPPLEMENT TREMBL  CANDIDATE GENES  R PACKAGE  TOOL  TRANSCRIPTOME  IDENTIFICATION  RANUNCULACEAE  PREDICTION  DIVERSITY  
Chromosome-scale genome assembly of sweet tea (Lithocarpus polystachyus Rehder) 期刊论文
SCIENTIFIC DATA, 2023, 卷号: 10, 期号: 1, 页码: 873
作者:  Liu,Hui;  Zhang,Rengang;  Zhou,Biao-Feng;  Shen,Zhao;  Chen,Xue-Yan;  Gao,Jie;  Wang,Baosheng
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DIHYDROCHALCONES  FAGACEAE  IDENTIFICATION  BIOACTIVITIES  TRANSCRIPTOME  CHALCONES  PROVIDES  SYSTEM  
Chromosome-level genome assembly of Murraya paniculata sheds light on biosynthesis of floral volatiles 期刊论文
BMC BIOLOGY, 2023, 卷号: 21, 期号: 1, 页码: 142
作者:  Yang,Tianyu;  Yin,Xin;  Kang,Haotong;  Yang,Danni;  Yang,Xingyu;  Yang,Yunqiang;  Yang,Yongping
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Murraya paniculata  Citrus species  Comparative genomics  Transposon  Flower volatiles  Phenylacetaldehyde  CITRUS  SYSTEM  RETROTRANSPOSONS  IDENTIFICATION  EVOLUTION  ALIGNMENT  PROVIDES  
Evolutionary history of two evergreen Rhododendron species as revealed by chromosome-level genome assembly 期刊论文
FRONTIERS IN PLANT SCIENCE, 2023, 卷号: 14, 页码: 1123707
作者:  Wu,Xiaopei;  Zhang,Lu;  Wang,Xiuyun;  Zhang,Rengang;  Jin,Guihua;  Hu,Yanting;  Yang,Hong;  Wu,Zhenzhen;  Ma,Yongpeng;  Zhang,Chengjun;  Wang,Jihua
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Rhododendron delavayi  Rhododendron irroratum  genome evolution  gene duplication  anthocyanin biosynthesis  NBS-encoding genes  MULTIPLE SEQUENCE ALIGNMENT  RICH REPEAT GENES  PHYLOGENETIC ANALYSIS  ARABIDOPSIS-THALIANA  WHOLE-GENOME  TOOL  PIGMENTATION  DUPLICATION  RESISTANCE  ACCURATE  
Insights into the differentiation and adaptation within Circaeasteraceae from Circaeaster agrestis genome sequencing and resequencing 期刊论文
ISCIENCE, 2023, 卷号: 26, 期号: 3, 页码: 106159
作者:  Sun,Yanxia;  Zhang,Aidi;  Zhang,Xu;  Landis,Jacob B.;  Zhang,Huajie;  Zhang,Xiujun;  Sun,Hang;  Wang,Hengchang
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DELETERIOUS MUTATIONS  POPULATION-SIZE  EVOLUTION  DIVERSITY  SELECTION  INTERFERENCE  PREDICTION  CONTRIBUTE  LINEAGES  FORMAT  
Genomic and structural basis for evolution of tropane alkaloid biosynthesis 期刊论文
PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA, 2023, 卷号: 120, 期号: 17, 页码: e2302448120
作者:  Wang,Yong-Jiang;  Tain,Tian;  Yu,Jia-Yi;  Li,Jie;  Xu,Bingyan;  Chen,Jianghua;  D'Auria,John C.;  Huang,Jian-Ping;  Huang,Sheng-Xiong
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tropane alkaloids  evolution  biosynthesis  genome  structural biology  METHYLTRANSFERASE  REVEAL  
基于牛角瓜基因组解析其种子纤维发育和镉胁迫响应的机理 学位论文
: 中国科学院大学, 2022
作者:  杨景雅
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牛角瓜，基因组，比较基因组，纤维发育，镉胁迫，分子机制  Calotropis, Genomics, Comparative genome, Fiber development, Cadmium stress, Molecular mechanism.  
构建多组学数据分析流程用于挖掘黄草乌生物碱合成相关基因 学位论文
: 中国科学院大学, 2022
作者:  任焕幸
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二萜生物碱  Diterpenoid alkaloids  比较基因组学  Comparative genomics  权重基因共表达网络  Weighted gene co-expression network  最小生成树  Minimum spanning tree  代谢网络  Metabolic network