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中国科学院昆明植物研究所知识管理系统
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Marsdenia tenacissima genome reveals calcium adaptation and tenacissoside biosynthesis
期刊论文
PLANT JOURNAL, 2023, 卷号: 113, 期号: 6, 页码: 1146-1159
作者:
Zhou,Yanli
;
Fan,Wei
;
Zhang,Haoyue
;
Zhang,Jingling
;
Zhang,Guanghui
;
Wang,Ding
;
Xiang,Guisheng
;
Zhao,Changhong
;
Li,Lianhua
;
He,Simei
;
Lu,Yingchun
;
Zhao,Jiuxia
;
Meng,Zhengui
;
Zhang,Xianmin
;
Meng,Hengling
;
Yin,Xinhua
;
Yang,Shengchao
;
Long,Guangqiang
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提交时间:2024/07/10
genome assembly
Hi-C
Apocynaceae
Ca2+ adaptation
cell-wall remodeling
Marsdenia tenacissima
CELL
GENES
TRANSCRIPTOME
MECHANISMS
ALIGNMENT
SOIL
Multi-omics analysis reveals the evolutionary origin of diterpenoid alkaloid biosynthesis pathways in Aconitum
期刊论文
JOURNAL OF INTEGRATIVE PLANT BIOLOGY, 2023, 卷号: 65, 期号: 10, 页码: 2320-2335
作者:
Zhao,Dake
;
Zhang,Ya
;
Ren,Huanxing
;
Shi,Yana
;
Dong,Ding
;
Li,Zonghang
;
Cui,Guanghong
;
Shen,Yong
;
Mou,Zongmin
;
Kennelly,Edward J.
;
Huang,Luqi
;
Ruan,Jue
;
Chen,Suiyun
;
Yu,Diqiu
;
Cun,Yupeng
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提交时间:2024/07/25
Aconitum vilmorinianum
acute toxicity
biosynthetic pathway
diterpenoid alkaloid
evolutionary origin
genome assembly
PHYLOGENETIC ANALYSIS
SUPPLEMENT TREMBL
CANDIDATE GENES
R PACKAGE
TOOL
TRANSCRIPTOME
IDENTIFICATION
RANUNCULACEAE
PREDICTION
DIVERSITY
Telomere-to-telomere and haplotype-resolved genome assembly of the Chinese cork oak (Quercus variabilis)
期刊论文
FRONTIERS IN PLANT SCIENCE, 2023, 卷号: 14, 页码: 1290913
作者:
Wang,Longxin
;
Li,Lei-Lei
;
Chen,Li
;
Zhang,Ren-Gang
;
Zhao,Shi-Wei
;
Yan,Han
;
Gao,Jie
;
Chen,Xue
;
Si,Yu-Jun
;
Chen,Zhe
;
Liu,Haibo
;
Xie,Xiao-Man
;
Zhao,Wei
;
Han,Biao
;
Qin,Xiaochun
;
Jia,Kai-Hua
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提交时间:2024/05/09
Quercus variabilis
genome assembly
telomere-to-telomere
gap-less
haplotype-resolved
PROGRAM
PROTEIN
TRANSCRIPTOME
ALIGNMENTS
PROVIDES
SYSTEM
高山大黄属“温室植物”基因组的组装与注释
学位论文
: 中国科学院大学, 2022
作者:
匡田辉
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提交时间:2024/05/14
高山,温室植物,基因组,组装,注释
Alpine, Greenhouse-Plant, Genome, Assembly, Annotation
基于Snakemake构建不同杂合度区间的基因组组装流程
学位论文
: 中国科学院大学, 2022
作者:
黄艺伟
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浏览/下载:11/0
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提交时间:2024/05/14
Snakemake,基因组组装,杂合度,兰属
Snakemake, Genome Assembly, Heterozygosity, Cymbidium
Chromosome-Level Genome Assembly of the Rare and Endangered Tropical Plant Speranskia yunnanensis (Euphorbiaceae)
期刊论文
FRONTIERS IN GENETICS, 2022, 卷号: 12, 页码: 755564
作者:
Guofang, Yuan
;
Shufang, Tan
;
Dandan, Wang
;
Yongzhi, Yang
;
Bin, Tian
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提交时间:2024/08/21
genome assembly
chromosome-level genome
phylogenetic relationships
evolution
Speranskia yunnanensis
GENERATION
PROVIDES
DATABASE
PROGRAM
SYSTEM
GENES
High-quality genome assembly of an important biodiesel plant, Euphorbia lathyris L
期刊论文
DNA RESEARCH, 2021, 卷号: 28, 期号: 6, 页码: 8
作者:
Wang, Mingcheng
;
Gu, Zhijia
;
Fu, Zhixi
;
Jiang, Dechun
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提交时间:2022/07/15
caper spurge
biodiesel plant
genome assembly
nanopore sequencing
oil metabolism
High-quality genome assembly of an important biodiesel plant, Euphorbia lathyris L.
期刊论文
DNA RESEARCH, 2021, 卷号: 28, 期号: 6, 页码: dsab022
作者:
Wang,Mingcheng
;
Gu,Zhijia
;
Fu,Zhixi
;
Jiang,Dechun
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浏览/下载:132/60
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提交时间:2022/04/02
caper spurge
biodiesel plant
genome assembly
nanopore sequencing
oil metabolism
PHYLOGENETIC ANALYSIS
FOSSIL-FUELS
ANNOTATION
TOOL
IDENTIFICATION
PREDICTION
DATABASE
SEEDS
GENE
De novo genome assembly of the endangered Acer yangbiense, a plant species with extremely small populations endemic to Yunnan Province, China
期刊论文
GIGASCIENCE, 2019, 卷号: 8, 期号: 7, 页码: 10
作者:
Yang, Jing
;
Wariss, Hafiz Muhammad
;
Tao, Lidan
;
Zhang, Rengang
;
Yun, Quanzheng
;
Hollingsworth, Peter
;
Dao, Zhiling
;
Luo, Guifen
;
Guo, Huijun
;
Ma, Yongpeng
;
Sun, Weibang
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提交时间:2019/10/28
Acer Yangbiense
Psesp
Pacbio Sequencing
Genome Assembly
Genome Annotation
Genome sequence of Malania oleifera, a tree with great value for nervonic acid production
期刊论文
GIGASCIENCE, 2019, 卷号: 8, 期号: 2, 页码: 14
作者:
Xu, Chao-Qun
;
Liu, Hui
;
Zhou, Shan-Shan
;
Zhang, Dong-Xu
;
Zhao, Wei
;
Wang, Sihai
;
Chen, Fu
;
Sun, Yan-Qiang
;
Nie, Shuai
;
Jia, Kai-Hua
;
Jiao, Si-Qian
;
Zhang, Ren-Gang
;
Yun, Quan-Zheng
;
Guan, Wenbin
;
Wang, Xuewen
;
Gao, Qiong
;
Bennetzen, Jeffrey L.
;
Maghuly, Fatemeh
;
Porth, Ilga
;
Van de Peer, Yves
;
Wang, Xiao-Ru
;
Ma, Yongpeng
;
Mao, Jian-Feng
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提交时间:2019/07/29
de novo genome assembly
vulnerable plant
Malania
nervonic acid
transcriptomes