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Phylotranscriptomic analyses reveal deep gene tree discordance in Camellia (Theaceae) 期刊论文
MOLECULAR PHYLOGENETICS AND EVOLUTION, 2023, 卷号: 188, 页码: 107912
作者:  Zhang,Qiong;  Folk,Ryan A.;  Mo,Zhi-Qiong;  Ye,Hang;  Zhang,Zhao-Yuan;  Peng,Hua;  Zhao,Jian-Li;  Yang,Shi-Xiong;  Yu,Xiang-Qin
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Camellia  Gene tree discordance  Transcriptome  Rapid diversification  Selective pressure  RNA-SEQ DATA  PHYLOGENETIC ANALYSIS  NUCLEAR GENES  SEQUENCE  EVOLUTION  RESOLUTION  HISTORY  INFERENCE  ALGORITHM  SELECTION  
构建多组学数据分析流程用于挖掘黄草乌生物碱合成相关基因 学位论文
: 中国科学院大学, 2022
作者:  任焕幸
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二萜生物碱  Diterpenoid alkaloids  比较基因组学  Comparative genomics  权重基因共表达网络  Weighted gene co-expression network  最小生成树  Minimum spanning tree  代谢网络  Metabolic network  
Phylogenomic conflict coincides with rapid morphological innovation 期刊论文
PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA, 2021, 卷号: 118, 期号: 19, 页码: e2023058118
作者:  Parins-Fukuchi,Caroline;  Stull,Gregory W.;  Smith,Stephen A.
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phylogenomics  morphological evolution  gene-tree discordance  tempo and mode  molecular evolution  GENE TREE DISCORDANCE  FOSSIL FLOWERS  SEED PLANTS  CARYOPHYLLALES  EVOLUTION  ORIGIN  ANCIENT  ROOT  LIFE  DIVERSIFICATION  
Phylogeny and biogeography of Fagus (Fagaceae) based on 28 nuclear single/low-copy loci 期刊论文
JOURNAL OF SYSTEMATICS AND EVOLUTION, 2021
作者:  Jiang,Lu;  Bao,Qin;  He,Wei;  Fan,Deng-Mei;  Cheng,Shan-Mei;  Lopez-Pujol,Jordi;  Chung,Myong Gi;  Sakaguchi,Shota;  Sanchez-Gonzalez,Arturo;  Gedik,Aysun;  Li,De-Zhu;  Kou,Yi-Xuan;  Zhang,Zhi-Yong
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biogeography  Fagus  nuclear single-copy gene  phylogeny  species tree  MULTINERVIS NAKAI FAGACEAE  NORTHERN-HEMISPHERE  GENETIC-VARIATION  TIBETAN PLATEAU  WESTERN EURASIA  LAND BRIDGES  SYLVATICA L.  SEQUENCE  BEECH  EVOLUTION  
Phylogenomic analyses of large-scale nuclear genes provide new insights into the evolutionary relationships within the rosids 期刊论文
MOLECULAR PHYLOGENETICS AND EVOLUTION, 2016, 卷号: 105, 期号: 1, 页码: 166-176
作者:  Zhao, Lei;  Li, Xia;  Zhang, Ning;  Zhang, Shu-Dong;  Yi, Ting-Shuang;  Ma, Hong;  Guo, Zhen-Hua;  Li, De-Zhu
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Coalescence  Rosids Phylogenomics  Nuclear Genes  Gene Tree  Species Tree  
The timing and the mode of evolution of wild grapes (Vitis) 期刊论文
MOLECULAR PHYLOGENETICS AND EVOLUTION, 2012, 卷号: 62, 期号: 2, 页码: 736-747
Zecca, Giovanni; Abbott, J. Richard; Sun, Wei-Bang; Spada, Alberto; Sala, Francesco; Grassi, Fabrizio
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Vitis  Molecular Phylogeny  Hypothesis Testing  Divergence Time Estimate  Network  Tertiary-quaternary Debate  Grapes  Phylogenetic Tree Selection  Rpb2 Gene  Molecular Phylogeny  Flowering Plants  Dna-sequences  Mixed Models  Vitaceae  Diversity  Inference  Family  
A geraniol-synthase gene from Cinnamomum tenuipilum 期刊论文
PHYTOCHEMISTRY, 2005, 卷号: 66, 期号: 3, 页码: 285-293
作者:  Yang, T;  Li, J;  Wang, HX;  Zeng, Y
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Cinnamomum Tenuipilum  Lauraceae  Camphor Tree  Functional Expression  Chemotypes  Essential Oil  Ctges Gene  Geraniol Synthase  Monoterpene Synthases