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New Genes Interacted With Recent Whole-Genome Duplicates in the Fast Stem Growth of Bamboos 期刊论文
MOLECULAR BIOLOGY AND EVOLUTION, 2021, 卷号: 38, 期号: 12, 页码: 5752-5768
作者:  Jin,Guihua;  Ma,Peng-Fei;  Wu,Xiaopei;  Gu,Lianfeng;  Long,Manyuan;  Zhang,Chengjun;  Li,De-Zhu
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fast stem growth  orphan genes  de novo genes  WGD  woody bamboos  evolutionary innovation  EVOLUTIONARY ORIGIN  DROSOPHILA-MELANOGASTER  PHYLOGENETIC ANALYSIS  VERTEBRATE EVOLUTION  RAPID EVOLUTION  HUMAN TISSUE  YOUNG GENES  TRANSCRIPTION  EXPRESSION  HOURGLASS  
Phylogeny and biogeography of Fagus (Fagaceae) based on 28 nuclear single/low-copy loci 期刊论文
JOURNAL OF SYSTEMATICS AND EVOLUTION, 2021
作者:  Jiang,Lu;  Bao,Qin;  He,Wei;  Fan,Deng-Mei;  Cheng,Shan-Mei;  Lopez-Pujol,Jordi;  Chung,Myong Gi;  Sakaguchi,Shota;  Sanchez-Gonzalez,Arturo;  Gedik,Aysun;  Li,De-Zhu;  Kou,Yi-Xuan;  Zhang,Zhi-Yong
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biogeography  Fagus  nuclear single-copy gene  phylogeny  species tree  MULTINERVIS NAKAI FAGACEAE  NORTHERN-HEMISPHERE  GENETIC-VARIATION  TIBETAN PLATEAU  WESTERN EURASIA  LAND BRIDGES  SYLVATICA L.  SEQUENCE  BEECH  EVOLUTION  
Genetic innovations: Transposable element recruitment and de novo formation lead to the birth of orphan genes in the rice genome 期刊论文
JOURNAL OF SYSTEMATICS AND EVOLUTION, 2021, 卷号: 59, 期号: 2, 页码: 341-351
作者:  Jin,Gui-Hua;  Zhou,Yan-Li;  Yang,Hong;  Hu,Yan-Ting;  Shi,Yong;  Li,Ling;  Siddique,Abu N.;  Liu,Chang-Ning;  Zhu,An-Dan;  Zhang,Cheng-Jun;  Li,De-Zhu
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comparative genomics  origin  orphan gene  transposable element  LINEAGE-SPECIFIC GENES  EVOLUTION  ORIGIN  IDENTIFICATION  EMERGENCE  PROTEIN  DUPLICATION  ALIGNMENT  SETS