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Haplotype-resolved genomes of wild octoploid progenitors illuminate genomic diversifications from wild relatives to cultivated strawberry 期刊论文
NATURE PLANTS, 2023, 卷号: 9, 期号: 8, 页码: 1252-+
作者:  Jin,Xin;  Du,Haiyuan;  Zhu,Chumeng;  Wan,Hong;  Liu,Fang;  Ruan,Jiwei;  Mower,Jeffrey P.;  Zhu,Andan
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FRAGARIA  ACCURATE  RECONSTRUCTION  EVOLUTIONARY  ALIGNMENT  ORIGIN  POPULATIONS  ASSEMBLIES  ANNOTATION  GENERATION  
Multi-omics analysis reveals the evolutionary origin of diterpenoid alkaloid biosynthesis pathways in Aconitum 期刊论文
JOURNAL OF INTEGRATIVE PLANT BIOLOGY, 2023, 卷号: 65, 期号: 10, 页码: 2320-2335
作者:  Zhao,Dake;  Zhang,Ya;  Ren,Huanxing;  Shi,Yana;  Dong,Ding;  Li,Zonghang;  Cui,Guanghong;  Shen,Yong;  Mou,Zongmin;  Kennelly,Edward J.;  Huang,Luqi;  Ruan,Jue;  Chen,Suiyun;  Yu,Diqiu;  Cun,Yupeng
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Aconitum vilmorinianum  acute toxicity  biosynthetic pathway  diterpenoid alkaloid  evolutionary origin  genome assembly  PHYLOGENETIC ANALYSIS  SUPPLEMENT TREMBL  CANDIDATE GENES  R PACKAGE  TOOL  TRANSCRIPTOME  IDENTIFICATION  RANUNCULACEAE  PREDICTION  DIVERSITY  
New Genes Interacted With Recent Whole-Genome Duplicates in the Fast Stem Growth of Bamboos 期刊论文
MOLECULAR BIOLOGY AND EVOLUTION, 2021, 卷号: 38, 期号: 12, 页码: 5752-5768
作者:  Jin,Guihua;  Ma,Peng-Fei;  Wu,Xiaopei;  Gu,Lianfeng;  Long,Manyuan;  Zhang,Chengjun;  Li,De-Zhu
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fast stem growth  orphan genes  de novo genes  WGD  woody bamboos  evolutionary innovation  EVOLUTIONARY ORIGIN  DROSOPHILA-MELANOGASTER  PHYLOGENETIC ANALYSIS  VERTEBRATE EVOLUTION  RAPID EVOLUTION  HUMAN TISSUE  YOUNG GENES  TRANSCRIPTION  EXPRESSION  HOURGLASS  
A hypothesis on cupule evolution and the evidence from molecular phylogenies and fossils 期刊论文
JOURNAL OF SYSTEMATICS AND EVOLUTION, 2008, 卷号: 46, 期号: 1, 页码: 41-52
作者:  Chen, Ya-Qiong;  Deng, Min;  Zhou, Zhe-Kun
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Cupule  Evolutionary Hypotheses  Fagaceae  Fossil  Molecular Phylogeny  Origin