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Comparative Analysis and Characterization of Ten Complete Chloroplast Genomes of Eremurus Species (Asphodelaceae)
期刊论文
FORESTS, 2023, 卷号: 14, 期号: 9, 页码: 1709
作者:
Makhmudjanov,Dilmurod
;
Abdullaev,Davlatali
;
Juramurodov,Inom
;
Tuychiev,Shakhzodbek
;
Yusupov,Ziyoviddin
;
Sun,Hang
;
Tojibaev,Komiljon
;
Deng,Tao
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提交时间:2024/05/09
Eremurus
chloroplast genome
codon usage
comparative analysis
phylogeny
protein-coding genes
MULTIPLE SEQUENCE ALIGNMENT
PHYLOGENETIC ANALYSIS
GENE-EXPRESSION
TRNL-F
SYSTEMATICS
EVOLUTION
INTRON
TOOL
First comparative analysis of complete chloroplast genomes among six Hedysarum (Fabaceae) species
期刊论文
FRONTIERS IN PLANT SCIENCE, 2023, 卷号: 14, 页码: 1211247
作者:
Juramurodov,Inom
;
Makhmudjanov,Dilmurod
;
Yusupov,Ziyoviddin
;
Tojibaev,Komiljon
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提交时间:2024/05/09
Hedysarum
chloroplast genome
comparative analysis
phylogeny
protein-coding genes
MAXIMUM-LIKELIHOOD
GENE-EXPRESSION
TRNL-F
SEQUENCE
MATK
ORGANIZATION
SYSTEMATICS
PHYLOGENY
INTRON
NRDNA
Phylogeny and evolution of chloroplast tRNAs in Adoxaceae
期刊论文
ECOLOGY AND EVOLUTION, 2021, 卷号: 11, 期号: 3, 页码: 1294-1309
作者:
Zhong,Qiu-Yi
;
Fu,Xiao-Gang
;
Zhang,Ting-Ting
;
Zhou,Tong
;
Yue,Ming
;
Liu,Jian-Ni
;
Li,Zhong-Hu
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提交时间:2022/04/02
anticodon
chloroplast tRNA
intron
phylogeny
transition
transversion
NONOPTIMAL CODON USAGE
HORIZONTAL TRANSFER
GENE DUPLICATION
GENOME
MITOCHONDRIAL
ORIGIN
TRANSLATION
SEQUENCES
ACID
DNA
Organelle Genomes and Transcriptomes of Nymphaea Reveal the Interplay between Intron Splicing and RNA Editing
期刊论文
INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES, 2021, 卷号: 22, 期号: 18, 页码: 9842
作者:
He,Zheng-Shan
;
Zhu,Andan
;
Yang,Jun-Bo
;
Fan,Weishu
;
Li,De-Zhu
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提交时间:2022/04/02
Nymphaea
organelle genomes
transcriptomes
intron splicing
RNA editing
MESSENGER-RNA
PLANT-MITOCHONDRIA
WHEAT
CHLOROPLASTS
ACCURATE
SITES
EXPRESSION
EVOLUTION
ALIGNMENT
PROTEINS
Plastid phylogenomic insights into the evolution of subfamily Dialioideae (Leguminosae)
期刊论文
PLANT DIVERSITY, 2021, 卷号: 43, 期号: 1, 页码: 27-34
作者:
Bai,Han-Rui
;
Oyebanji,Oyetola
;
Zhang,Rong
;
Yi,Ting-Shuang
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提交时间:2022/04/02
Dialioideae
Plastome
IR expansion/contraction
Fabaceae
Variation
CHLOROPLAST GENOME
SEQUENCE
LOSSES
INTRON
CAESALPINIOIDEAE
INVERSION
Alternative splicing coupled to nonsense-mediated mRNA decay contributes to the high-altitude adaptation of maca (Lepidium meyenii)
期刊论文
GENE, 2019, 卷号: 694, 页码: 7-18
作者:
Shi, Yong
;
Su, Zechun
;
Yang, Hong
;
Wang, Wenzhi
;
Jin, Guihua
;
He, Guiqing
;
Siddique, Abu Nasar
;
Zhang, Liangsheng
;
Zhu, Andan
;
Xue, Runguang
;
Zhang, Chengjun
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提交时间:2019/07/29
Alpine plants
Post-transcriptome
Intron retention
Alternative 3 ' splice site
Long non-coding RNA
Positive selection
Genome-wide RAD sequencing data provide unprecedented resolution of the phylogeny of temperate bamboos (Poaceae: Bambusoideae)
期刊论文
SCIENTIFIC REPORTS, 2017, 卷号: 7, 期号: 1, 页码: 11546
作者:
Wang, Xueqin
;
Ye, Xiaying
;
Zhao, Lei
;
Li, Dezhu
;
Guo, Zhenhua
;
Zhuang, Huifu
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提交时间:2017/10/23
Arundinarieae Poaceae
Population Genomics
Inferring Phylogeny
Thamnocalamus Group
Allies Gramineae
Rpl16 Intron
Gbssi Gene
Evolution
Identification
Framework
Intron retention and 3′-UTR analysis of Arabidopsis Dicer-like 2transcripts
期刊论文
Mol Biol Rep, 2012, 卷号: 39, 期号: 0, 页码: 3271–3280
作者:
Qiongji He
;
Jiejun Peng
;
Fei Yan
;
Lin Lin
;
Yuwen Lu
;
Hongying Zheng
;
Hairu Chen
;
Jianping Chen
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提交时间:2017/07/26
Alternative Splicing
Dicer-like Protein
Intron Retention
3′untranslated Region
Molecular authentication of the traditional Tibetan medicinal plant, Meconopsis impedita
期刊论文
AFRICAN JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY, 2011, 卷号: 10, 期号: 38, 页码: 7493-7496
作者:
Li, Rong
;
Dao, Zhiling
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提交时间:2012/03/16
Meconopsis Impedita
The Rps16 Intron
Species-specific Pcr
Molecular Authentication
Phylogeny of Bambusa and its allies (Poaceae: Bambusoideae) inferred from nuclear GBSSI gene and plastid psbA-trnH, rpl32-trnL and rps16 intron DNA sequences
期刊论文
TAXON, 2010, 卷号: 59, 期号: 4, 页码: 1102-1110
作者:
Yang, Jun-Bo
;
Yang, Han-Qi
;
Li, De-Zhu
;
Wong, Khoon-Meng
;
Yang, Yu-Ming
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提交时间:2012/07/18
Bambusa
Bambusinae
Dendrocalamus
Gbssi Gene
Paleotropical Bamboo Clade
Psba-trnh
Rpl32-trnl
Rps16 Intron