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Dynamics of imprinted genes and their epigenetic mechanisms in castor bean seed with persistent endosperm 期刊论文
NEW PHYTOLOGIST, 2023, 卷号: 240, 期号: 5, 页码: 1868-1882
作者:  Han,Bing;  Li,Yelan;  Wu,Di;  Li,De-Zhu;  Liu,Aizhong;  Xu,Wei
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castor bean  DNA methylation  endosperm  epigenetic mechanisms  genomic imprinting  histone modifications  DNA METHYLATION  ARABIDOPSIS  EXPRESSION  EVOLUTION  PROTEIN  PLANTS  CONSERVATION  DEMETER  PHERES1  COAT  
Epigenetic regulation of seed-specific gene expression by DNA methylation valleys in castor bean 期刊论文
BMC BIOLOGY, 2022, 卷号: 20, 期号: 1, 页码: 57
作者:  Han, Bing;  Wu, Di;  Zhang, Yanyu;  Li, De-Zhu;  Xu, Wei;  Liu, Aizhong
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Seed-specific genes  DNA methylation valleys  Histone modifications  Enhancer  Castor bean  RICINUS-COMMUNIS L.  CENTRAL CELL  ARABIDOPSIS  EMBRYOGENESIS  TRANSCRIPTION  ENDOSPERM  IDENTIFICATION  ACCUMULATION  PLANTS  OIL  
Single-base methylome analysis reveals dynamic changes of genome-wide DNA methylation associated with rapid stem growth of woody bamboos 期刊论文
PLANTA, 2022, 卷号: 256, 期号: 3, 页码: 53
作者:  Niu, Liang-Zhong;  Xu, Wei;  Ma, Peng-Fei;  Guo, Zhen-Hua;  Li, De-Zhu
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DNA methylation  Gene expression  Internode elongation  Jasmonic acid  Woody bamboos  PHENYLALANINE AMMONIA-LYASE  MOLECULAR CHARACTERIZATION  CYTOSINE METHYLTRANSFERASE  INTERNODE ELONGATION  TRANSCRIPTION FACTOR  H3 LYSINE-9  ARABIDOPSIS  EXPRESSION  DEMETHYLATION  PROTEIN  
Genomic insights into the origin, domestication and genetic basis of agronomic traits of castor bean 期刊论文
GENOME BIOLOGY, 2021, 卷号: 22, 期号: 1, 页码: 113
作者:  Xu,Wei;  Wu,Di;  Yang,Tianquan;  Sun,Chao;  Wang,Zaiqing;  Han,Bing;  Wu,Shibo;  Yu,Anmin;  Chapman,Mark A.;  Muraguri,Sammy;  Tan,Qing;  Wang,Wenbo;  Bao,Zhigui;  Liu,Aizhong;  Li,De-Zhu
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Genomic evolution  Domestication  Population genetics  GWAS  Castor bean  SINGLE NUCLEOTIDE POLYMORPHISMS  SEED SIZE  PHYLOGENETIC ANALYSIS  CELL ELONGATION  PLANT-GROWTH  ARABIDOPSIS  ANNOTATION  PROVIDES  YIELD  TOOL