中国科学院昆明植物研究所机构知识库
Advanced  
KIB OpenIR  > 昆明植物所硕博研究生毕业学位论文  > 学位论文
题名: 查尔酮合酶(chalcone synthase,CHS)基因家族在被子植物中的分子进化和分子系统学应用研究
作者: 杨俊波
学位类别: 硕士
答辩日期: 2006-06-14
授予单位: 中国科学院昆明植物研究所
授予地点: 昆明植物研究所
导师: 李德铢
关键词: 被子植物 ; 查尔酮合酶(CHS)基因家族 ; 分子进化 ; 系统发育
学位专业: 植物学
中文摘要: 本论文用PCR、克隆、测序的方法,从18个科的61种被子植物中得到了215 条CHS基因外显子2的部分序列。对这些序列的分析表明,所有序列有较高的相似性(>70%)和氨基酸组成,多数序列具有典型的CHS基因功能,部分序列由于底物结合位点和组成环化反应口袋的氨基酸残基发生了突变可能具有了新功能,进一步的分析表明,这些可能具有了新功能的序列是在不同科内独立发生的,并且在不同科内的分布也不一样。此外,在各类群中,CHS基因外显子2的密码子使用有明显差异,一些类群明显偏好G和C,另一些类群则偏好A和T,多数类群密码子的使用较为平均。在多个类群中发现含有碱基插入/缺失的假基因。 通过对本实验室有良好研究基础的木通科、木兰科、三白草科和山茶科进行科内取样的研究表明,这些科的CHS基因多来源于在科形成前发生重复了的不同拷贝,这些拷贝在不同的类群中经历了不同的进化历程,有的拷贝在某些种内丢失了,而有的拷贝则发生了重复,一些类群中重复/丢失事件在近期可能还在发生。进一步分析的结果显示CHS基因家族主要经历了一个所谓“生-和-灭”的进化模式,该模式以频繁的基因重复和假基因化为主要特征,在这一过程中纯化选择占主导作用,但在一些物种的某些位点可能也存在正选择或纯化选择压力得到了放松。 通过对上述四科CHS基因家族所构建的系统树和已有的这些科的系统关系的比较表明,虽然在一些科内CHS基因能部分反映物种的系统关系,但由于该基因家族的进化特点决定了其较低的系统学应用价值。 利用已有的被子植物CHS基因家族成员所建的系统树主要由两个大的分支组成,有的植物的CHS基因家族成员在系统树的两个分支上分布,而有的植物的CHS基因家族成员只在系统树的其中一个分支上分布,这表明被子植物CHS基因家族各成员可能来源于其形成前的两到三个拷贝,并且各拷贝在不同植物中的进化有不同的命运。
语种: 中文
内容类型: 学位论文
URI标识: http://ir.kib.ac.cn/handle/151853/52
Appears in Collections:昆明植物所硕博研究生毕业学位论文_学位论文

Files in This Item:
File Name/ File Size Content Type Version Access License
10001_200228010602221杨俊波_null.pdf(4422KB)----限制开放-- 联系获取全文

Recommended Citation:
查尔酮合酶(chalcone synthase,CHS)基因家族在被子植物中的分子进化和分子系统学应用研究.杨俊波[d].中国科学院昆明植物研究所,2006.20-25
Service
Recommend this item
Sava as my favorate item
Show this item's statistics
Export Endnote File
Google Scholar
Similar articles in Google Scholar
[杨俊波]'s Articles
CSDL cross search
Similar articles in CSDL Cross Search
[杨俊波]‘s Articles
Related Copyright Policies
Null
Social Bookmarking
Add to CiteULike Add to Connotea Add to Del.icio.us Add to Digg Add to Reddit
所有评论 (0)
暂无评论
 
评注功能仅针对注册用户开放,请您登录
您对该条目有什么异议,请填写以下表单,管理员会尽快联系您。
内 容:
Email:  *
单位:
验证码:   刷新
您在IR的使用过程中有什么好的想法或者建议可以反馈给我们。
标 题:
 *
内 容:
Email:  *
验证码:   刷新

Items in IR are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.

 

 

Valid XHTML 1.0!
Copyright © 2007-2017  中国科学院昆明植物研究所 - Feedback
Powered by CSpace