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题名: 竹亚科叶绿体DNA条形码筛选
作者: 张玉霄 ; 许宇星 ; 马朋飞 ; 张丽娜 ; 李德铢*
刊名: 植物分类与资源学报
关键词: 竹亚科 ; DNA条形码 ; 插入/缺失 ; 分子系统学 ; 叶绿体片段筛选
中文摘要: 竹亚科是一个形态上鉴定困难且易于混淆的类群。DNA条形码技术为这一类群的鉴定提供了一个辅助手段。核心条形码(rbcL+matK)在竹亚科中的鉴别率很低,因此,有必要针对竹亚科筛选有效的DNA条形码片段。本研究根据已发表的竹亚科叶绿体基因组序列,筛选出16个片段,包括1个基因片段和15个基因间隔区,选取青篱竹族和箣竹族的10属22种30个个体,进行引物通用性、测序成功率和变异位点分析。研究结果表明:(1)引物具有较高的扩增成功率,但部分片段中由于存在poly结构造成测序失败;(2)片段中的插入/缺失可以编码,作为信息位点;(3)trnG-trnT(t)具有最多变异位点,建议可作为竹亚科优先选择的DNA条形码;(4)在开展不同类群的DNA条形码和分子系统学研究时,可以按照"trnG-trnT(t)+X"的方式选择合适的叶绿体DNA片段。
出版日期: 2013
期号: 6, 页码:743-750
语种: 中文
ISSN号: 2095-0845
内容类型: 期刊论文
URI标识: http://ir.kib.ac.cn/handle/151853/17918
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张玉霄;许宇星;马朋飞;张丽娜;李德铢*;.竹亚科叶绿体DNA条形码筛选,植物分类与资源学报,2013,(6):743-750
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