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题名: 裸子植物DNA条形码ITS2高通用性引物的筛选(英文)
作者: 李燕 ; 吴丁 ; 高连明*
刊名: 植物分类与资源学报
关键词: DNA条形码 ; 裸子植物 ; ITS2 ; 引物通用性 ; 物种鉴定
中文摘要: DNA条形码技术是利用标准DNA片段进行准确快速鉴定物种的一种方法,理想的DNA条形码片段应具有高通用性。虽然核糖体DNA内部转录间隔区II(ITS2)被建议作为种子植物有效的DNA条形码,但目前裸子植物还没有通用性高的引物可用。为获得高通用性的ITS2引物,本研究基于裸子植物55个属的5.8S基因的保守序列区设计了3个正向引物,与已有的ITS反向引物组合,组成了7对ITS2引物进行通用性的评价。选取了裸子植物8目、12科和40属的56个种用于本文的研究。引物组合5.8SR/ITS4、5.8SRa/ITS4和5.8SF2/S3R因为在科水平评价中通用性低或者产生的PCR产物有双带,因而排除在全部物种水平上进一步评价。其余4对引物(GYM_5.8SF1/ITS4、GYM_5.8SF1/S3R、GYM_5.8SF2/ITS4和S2F/S3R)在56个物种的PCR检测中,均有100%的扩增率。基于PCR产物的亮度、序列质量和正反向引物覆盖率的综合评价,建议引物GYM_5.8SF2/ITS4作为裸子植物条形码片段ITS2最好的通用引物。
出版日期: 2013
期号: 6, 页码:751-760
语种: 英语
ISSN号: 2095-0845
内容类型: 期刊论文
URI标识: http://ir.kib.ac.cn/handle/151853/17786
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李燕;吴丁;高连明*;.裸子植物DNA条形码ITS2高通用性引物的筛选(英文),植物分类与资源学报,2013,(6):751-760
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