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题名: miR156靶基因SPL在植物中的系统分布和进化模式分析(英文)
作者: 凌立贞 ; 张书东
刊名: 植物分类与资源学报
关键词: 系统分析 ; 基因重复 ; 基因结构 ; microRNA ; 转录因子
中文摘要: Squamosa promoter-binding protein-like genes(SPLs)在植物发育过程中具有重要作用。很多SPLs被miR156调节,然而,对于它们在植物中的系统分布和进化模式还知之甚少。本文对9个测序物种(藻类,苔藓,石松,单子叶和双子叶植物)的183个SPLs进行了生物信息学分析。结果表明miR156应答元件(MREs)仅在陆生植物SPLs中发现,藻类中不存在。系统进化分析显示陆生植物SPLs分为两大分支:groupI和groupII。MiR156靶基因仅分布于groupII,表明它们有着共同的祖先。GroupII进一步分为7个亚支(IIa-IIg),miR156靶基因分布在除IId外的其余6个亚支的特定SPLs。系统分类与基因结构的相关性反映了SPL靶基因结构上的变化。在进化过程中,它们可能发生外显子的丢失且伴随MRE的丢失。另外,基因重复对SPL靶基因的丰度变化影响很大,尤其是被子植物与低等植物分歧后它们数量明显增加。以拟南芥为模式植物分析发现串联重复和片段重复是SPL靶基因扩张的主要机制。
出版日期: 2012
卷号: 34, 期号:1, 页码:33-46
语种: 中文
收录类别: cscd
ISSN号: 2095-0845
Citation statistics:
内容类型: 期刊论文
URI标识: http://ir.kib.ac.cn/handle/151853/15356
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凌立贞;张书东.miR156靶基因SPL在植物中的系统分布和进化模式分析(英文),植物分类与资源学报,2012,34(1):33-46
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