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重楼属叶绿体系统发育基因组学研究 | |
李晓娟 | |
Thesis Advisor | 纪运恒 |
Degree Discipline | 植物学 |
Keyword | 重楼属 黑药花科 叶绿体基因组 基因组特征 系统关系 |
Abstract | 重楼属植物具有重要的药用价值,对该类群有大量的研究,不过重楼属的系统关系依旧存在疑点,主要表现:重楼属在百合目的系统位置;重楼属内系统关系。利用Illumina 测序技术及叶绿体基因组拼接软件获得11 种重楼属植物、延龄草(Trillium tschonoskii Maxim.)和丫蕊花(Ypsilandra thibetica Franch.)共黑药花科(Melanthiaceae)13 个种叶绿体全基因组序列。运用生物信息学方法对这黑药花科13 个种的叶绿体基因组进行比较分析基因组特征,重复序列,核苷酸同义替代率(dS),非同义替代率(dN),及非同义替代率与同义替代率的比例(dN/ dS)。进一步,基于76 个叶绿体蛋白质编码序列分别重建60 种单子叶植物和黑药花科16 个种系统发育树。以期揭示重楼属的叶绿体基因组信息,并阐明上述两个疑点。 |
Language | 中文 |
2015-05 | |
Degree Grantor | 中国科学院大学 |
Document Type | 学位论文 |
Identifier | http://ir.kib.ac.cn/handle/151853/51116 |
Collection | 昆明植物所硕博研究生毕业学位论文 |
Affiliation | 中国科学院昆明植物研究所 |
Recommended Citation GB/T 7714 | 李晓娟. 重楼属叶绿体系统发育基因组学研究[D]. 昆明. 中国科学院大学,2015. |
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李晓娟.pdf(22412KB) | 学位论文 | 限制开放 | CC BY-NC-SA | Application Full Text |
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