KIB OpenIR  > 昆明植物所硕博研究生毕业学位论文
稻属AA-基因组物种的重复序列研究
张群洁
Thesis Advisor高立志
2014-05
Degree Grantor中国科学院大学
Place of Conferral北京
Degree Discipline植物学
Keyword稻属aa-基因组物种 全基因组测序 Ltr逆转录转座子 Ssrs 转座子-基因
Abstract本研究通过Solexa测序,SOAPdenovo拼接的方法获得了稻属AA-基因组5个物种(O. nivara、O. glaberrima、O. barthii、O. glumapaetula 和O. meridionalis)的基因组草图。拼接长度从335 Mb至375 Mb不等,蛋白编码区覆盖度均超过95.8%。这一成果为开展稻属AA-基因组物种的比较基因组学研究,阐明植物近缘物种基因组结构变异及进化机制提供了重要基础。在构建二代测序技术拼接平台的过程中,本工作还获得了完整的P. euphratica叶绿体基因组序列。该叶绿体基因组大小为156,766 bp,包含130个已知基因,其中89个属于蛋白编码基因,8个rRNA基因,37个tRNA基因。
Language中文
Document Type学位论文
Identifierhttp://ir.kib.ac.cn/handle/151853/25771
Collection昆明植物所硕博研究生毕业学位论文
Affiliation中国科学院昆明植物研究所
First Author Affilication中国科学院昆明植物研究所
Recommended Citation
GB/T 7714
张群洁. 稻属AA-基因组物种的重复序列研究[D]. 北京. 中国科学院大学,2014.
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