刚竹属(Phyllostachys Sieb. et Zucc.)及其近缘类群的系统发育研究
张丽娜
导师李德铢
学位专业植物学
关键词刚竹属 叶绿体非编码区片段 核基因 系统发育 基因树冲突
摘要刚竹属(Phyllostachys Sieb. et Zucc.)是竹类中建立比较早的一个大属,隶属于禾本科(Poaceae)竹亚科(Bambusoideae)青篱竹族(Arundinarieae),被划分为刚竹组(Phyllostachys sect. Phyllostachys)和水竹组(sect. Heterocladae Z.P. Wang et G. H. Ye)。先前大多数青篱竹族的分子系统学研究都是基于叶绿体数据,适用于青篱竹族系统发育研究的核基因片段很少。分子系统学研究结果表明刚竹属可能不为单系,该属与其它属的关系存在争议,刚竹属的属下种间关系也没有得到澄清。在前人研究的基础上,本研究选取刚竹属50 个种,青篱竹族19 个属作为刚竹属可能的近缘类群及箣竹族(Bambuseae)3 个种作为外类群,共91 个种为研究材料,利用6 个叶绿体非编码区片段重建了刚竹属及其近缘类群的系统发育关系,并利用基于水稻(Oryza sativa L. )和短柄草(Brachypodium distachyon (Huds.) Beauv.)的基因组数据及毛竹(Phyllostachys edulis (Carrière) J. Houzeau)和麻竹(Dendrocalamus latiflorus (Keng & P. C.Keng) L. C. Chia & H. L. Fung)的转录组数据找到的74 个单拷贝直系同源基因,使用二代测序技术对刚竹属及其近缘类群进行系统发育研究,在此基础上,探讨了基因树冲突的原因及可能发生在刚竹属及其近缘类群演化过程中的历史事件。
2014-05
学位授予单位中国科学院大学
文献类型学位论文
条目标识符http://ir.kib.ac.cn/handle/151853/25651
专题昆明植物所硕博研究生毕业学位论文
作者单位中国科学院昆明植物研究所
推荐引用方式
GB/T 7714
张丽娜. 刚竹属(Phyllostachys Sieb. et Zucc.)及其近缘类群的系统发育研究[D]. 北京. 中国科学院大学,2014.
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